肾性骨营养不良的精准医学方法

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05880914

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数据说明

疾病：肾性骨营养不良、慢性肾脏病、CKD-MBD、骨转换率异常、继发性甲状旁腺功能亢进。肾性骨营养不良（ROD）是一种涉及皮质骨质量和强度的复杂疾病。皮质骨受损是由甲状旁腺激素（PTH）水平升高与肾功能衰竭导致的骨激素变化共同作用所致。ROD几乎影响所有慢性肾脏病（CKD）患者，并导致皮质骨丢失、皮质型骨折及心血管事件。目前ROD治疗的目标是减少因肾性甲状旁腺功能亢进引起的高骨转换，但在低转换状态下该治疗为禁忌，而可靠确定低转换状态的方法尚缺乏。肾脏病改善全球预后（KDIGO）指南建议，治疗应以生物标志物PTH和骨特异性碱性磷酸酶（BSAP）为指导，且在骨转换低时不应进行治疗。

然而，尽管有这些推荐意见，在过去25年中，透析患者的皮质型骨折发生率却翻了一番。骨折减少方面的失败，部分原因在于PTH和BSAP是为识别小梁骨而非皮质骨的转换而开发的。此外，尽管KDIGO推荐使用四环素标记的骨活检来定义骨转换并指导治疗，但组织形态计量学同样基于小梁骨而非皮质骨的分析，而后者才是PTH作用的主要部位。该提案已发表的初步数据表明，小梁骨转换并不能很好地替代皮质骨转换，骨 compartments 之间的相关性仅为中等（R² 59%）。因此，目前尚存在一个未满足的需求，即识别具有高诊断准确性和临床实用性的生物标志物，用于识别低皮质骨转换（无论是否结合小梁骨转换），以指导治疗决策并用于临床试验。在已发表的数据中，研究者假设，一组预先定义的、调控成骨细胞（miRNA-30c、30b、125b）和破骨细胞（miRNA-155）发育的微小RNA（miRNA）子集，将成为准确反映

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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