NHLBI GO-ESP 早发心肌梗死外显子芯片数据集(Broad EOMI)

数据可用于早发心肌梗死相关遗传变异的病例对照分析,支持分类建模与关联研究(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。本站分类:循环系统疾病/其他

dbgap
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其他分类Case-Control
phs000936: NHLBI GO-ESP: Early-Onset Myocardial Infarction Exome Chip (Broad EOMI)

基本信息

模态
其他
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

NHLBI GO-ESP 早发心肌梗死外显子芯片数据集(Broad EOMI)

phs000936 是一个来自 NCBI dbGaP 的病例对照研究数据集,英文全称为 NHLBI GO-ESP: Early-Onset Myocardial Infarction Exome Chip (Broad EOMI)。该数据集围绕早发心肌梗死展开,属于循环系统疾病 / 其他分类,主题标签为病例对照。依据来源站描述,其可用于早发心肌梗死相关遗传变异的病例对照分析,支持分类建模与关联研究。数据集名称中的 Exome Chip 提示其与外显子芯片检测相关,Broad EOMI 则指向早发心肌梗死的研究方向。整体而言,该数据集面向心血管疾病遗传学研究,适合在病例对照框架下探索早发心肌梗死的遗传易感因素,为后续关联分析和分类建模提供数据基础。

【数据集背景】

该数据集来源于 NCBI dbGaP,是一项病例对照研究。其英文名称中包含 NHLBI GO-ESP 与 Early-Onset Myocardial Infarction Exome Chip 等标识,表明其与早发心肌梗死的外显子芯片研究相关。数据集所属分类为循环系统疾病 / 其他,主题标签为病例对照,说明其设计围绕病例与对照的比较展开,服务于疾病遗传学分析。

【数据内容】

源站将该数据集描述为 dbGaP study (Case-Control)。数据集名称中的 Exome Chip 提示其涉及外显子芯片相关数据,Early-Onset Myocardial Infarction 则表明研究对象为早发心肌梗死。关于具体的样本数量、变异位点数、字段结构、文件格式等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 收录的研究。其名称中的 NHLBI GO-ESP 与 Broad EOMI 指向相关研究项目与机构标识。关于样本采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批等具体信息,源站未提供。

【适用场景】

依据来源站描述,该数据可用于早发心肌梗死相关遗传变异的病例对照分析,支持分类建模与关联研究。其病例对照设计适合比较病例组与对照组在遗传变异上的差异,可用于探索与早发心肌梗死相关的候选变异,并可作为分类建模的数据基础。关于其他具体应用场景,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为 dbGaP 研究,通常需通过 dbGaP 的受控访问机制获取。关于具体的下载流程、访问权限申请步骤、数据处理与分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

源站将该数据集标注为病例对照研究,未提供关于数据质量、缺失率、批次效应、人群代表性等方面的具体信息。关于该数据集的局限性,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI dbGaP,使用时应遵循 dbGaP 的访问与使用规定。关于具体的引用文献、许可条款与数据使用协议,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000936

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Case-Control).

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