phs000606:心脏搭桥术后肝素诱导性血小板减少症

dbGaP研究(纵向、前瞻性、群体、测序)。本数据集为循环系统疾病领域公开数据集,主题涵盖循环系统疾病。本数据集为心血管系统疾病领域的基因组公开数据集,来源:dbgap,主题涵盖循环系统疾病。

dbgap
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基因组预测LongitudinalProspectivePopulationSequencing循环系统疾病心脏搭桥术后HIT
phs000606: HIT after Cardiac Bypass

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-06

资源简介

phs000606:心脏搭桥术后肝素诱导性血小板减少症

phs000606: HIT after Cardiac Bypass 是一个来源于 NCBI dbGaP 的公开研究数据集,其英文全称指向心脏搭桥术后肝素诱导性血小板减少症(HIT)这一临床问题。该数据集在分类上归属于循环系统疾病领域,同时被标记为“其他”类别,表明其内容可能涉及循环系统疾病与血液学、免疫学等交叉方向。从源站描述来看,该研究具有纵向、前瞻性、群体性和测序研究的基本特征,意味着数据是在一段时间内对群体样本进行前瞻性追踪,并包含测序相关数据。该数据集面向循环系统疾病领域的研究者开放,主题涵盖循环系统疾病,适合用于探索心脏搭桥术后并发症的相关问题。

【数据集背景】

该数据集对应的研究聚焦于心脏搭桥术后发生的肝素诱导性血小板减少症(HIT)。心脏搭桥手术是循环系统疾病领域常见的外科干预方式,而术后并发症的识别与管理是临床研究的重要方向。HIT 作为一种与肝素使用相关的免疫介导不良反应,在心脏手术患者中具有特定的研究价值。该数据集以纵向、前瞻性、群体和测序为特征,说明其设计目的在于通过长期追踪和群体层面的数据采集,结合测序信息,来观察或分析心脏搭桥术后 HIT 的发生、发展及相关因素。该数据集来源于 NCBI dbGaP,属于公开可获取的研究资源,服务于循环系统疾病领域的科学探索。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括 Longitudinal、Prospective、Population 和 Sequencing,分别对应纵向研究、前瞻性研究、群体研究和测序。这些标签共同勾勒出数据内容的基本轮廓:数据可能包含对研究群体在一段时间内的多次观察记录,且观察是向前瞻望的,而非回顾性收集。测序标签表明数据中可能包含与测序相关的信息,但具体测序类型、测序靶标、数据格式和规模等细节,源站未提供。该数据集被归类为循环系统疾病 / 其他,说明其内容既涉及循环系统疾病,也可能涉及其他相关领域。关于具体的变量字段、样本数量、随访时间点、测序数据的具体内容等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,具体来源于 dbGaP 研究。dbGaP 是美国国家生物技术信息中心(NCBI)下属的基因型与表型数据库,用于存储和分发基因型与表型关联研究的数据。源站描述将该研究标识为 Longitudinal、Prospective、Population、Sequencing,说明其采集方式具有纵向追踪、前瞻性设计、群体层面和测序参与的特点。关于具体的采集机构、采集地点、采集时间范围、样本纳入与排除标准、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于该数据集的特征,其适用场景可能包括:循环系统疾病领域中心脏搭桥术后并发症的研究,特别是与 HIT 相关的临床或分子层面分析;利用纵向和前瞻性设计进行术后结局的追踪研究;结合测序数据探索与 HIT 或心脏搭桥术后反应相关的遗传或分子特征;在群体层面开展循环系统疾病相关风险的观察性研究。由于该数据集被标记为群体和测序,也可能适用于需要群体规模数据与测序信息结合的分析场景。但具体适用的分析类型、研究问题和方法学要求,需依据数据实际内容确定,源站未提供进一步说明。

【使用方法】

该数据集来源于 NCBI dbGaP,通常 dbGaP 数据的使用需要遵循其数据访问和授权流程。研究者一般需要通过 dbGaP 平台了解该研究的具体数据描述、申请数据访问权限,并在获得授权后下载或分析数据。关于该数据集的具体访问级别、申请条件、所需审批步骤、数据下载格式和分析工具等,源站未提供。使用者在计划使用前应参考 dbGaP 官方说明和该研究对应的数据页面。

【质量与限制】

该数据集被描述为纵向、前瞻性、群体和测序研究,这些特征通常有助于提高研究设计的系统性和数据的时间维度价值。然而,关于该数据集的具体质量指标,如样本量、数据完整性、缺失率、测序深度、覆盖度、质控标准等,源站未提供。该数据集被归类为循环系统疾病 / 其他,可能意味着其内容覆盖范围较广或存在跨领域特征,但具体限制条件、偏倚风险、适用人群的代表性等,源站未提供。使用者应结合 dbGaP 页面上的原始说明评估其适用性。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。关于该数据集的具体引用格式、许可协议、数据使用 agreement、知识产权归属、是否需要向数据提供方致谢等,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集时,应查阅 dbGaP 官方页面及该研究对应的数据访问说明,以获取准确的引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000606

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Longitudinal, Prospective, Population, Sequencing).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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