NHLBI GO-ESP:心脏队列外显子组测序项目(FHS)
dbGaP研究(病例-队列、病例-对照、队列、患病同胞对、外显子组测序)。本数据集为循环系统疾病领域公开数据集,主题涵盖循环系统疾病。

基本信息
资源简介
NHLBI GO-ESP:心脏队列外显子组测序项目(FHS)
phs000401: NHLBI GO-ESP: Heart Cohorts Exome Sequencing Project (FHS) 是一项公开的循环系统疾病领域数据集,来源于 ncbi.nlm.nih.gov。该数据集属于 dbGaP 研究,涉及病例-队列、病例-对照、队列、患病同胞对以及外显子组测序等多种研究设计。其主题标签涵盖 Case-Cohort、Case-Control、Cohort、Affected Sib Pairs 和 Exome Sequencing,本站将其归类于循环系统疾病 / 其他。整体而言,该数据集围绕心脏队列的外显子组测序展开,为循环系统疾病相关研究提供了公开的数据资源。
【数据集背景】
该数据集英文全称为 phs000401: NHLBI GO-ESP: Heart Cohorts Exome Sequencing Project (FHS),属于 dbGaP 研究。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。从研究设计来看,该数据集涉及病例-队列、病例-对照、队列、患病同胞对以及外显子组测序。数据集的主题标签同样包括 Case-Cohort、Case-Control、Cohort、Affected Sib Pairs 和 Exome Sequencing。本站将其分类为循环系统疾病 / 其他,表明其领域归属为循环系统疾病。关于该数据集的具体研究背景、项目发起机构、研究目的等更详细的信息,源站未提供。
【数据内容】
该数据集的内容涉及心脏队列的外显子组测序。根据源站描述,其研究设计类型包括病例-队列、病例-对照、队列、患病同胞对和外显子组测序。主题标签也反映了上述研究设计类型。数据集被归类为循环系统疾病领域,主题涵盖循环系统疾病。关于数据集包含的具体样本数量、测序深度、覆盖基因范围、变异位点数量、临床变量种类等详细内容,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。其英文名称中包含 NHLBI GO-ESP 以及 Heart Cohorts Exome Sequencing Project (FHS)。关于数据采集的具体时间、地点、人群来源、纳入排除标准、测序平台、样本处理流程等信息,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于循环系统疾病领域的研究。由于其涉及外显子组测序,并且包含病例-队列、病例-对照、队列、患病同胞对等多种研究设计,可应用于与循环系统疾病相关的遗传变异分析、外显子组水平关联研究等场景。本站分类为循环系统疾病 / 其他,主题标签涵盖循环系统疾病。关于该数据集具体的适用分析类型、可回答的科学问题、推荐的研究方向等,源站未提供。
【使用方法】
该数据集为公开数据集,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据的具体下载方式、访问权限、所需工具、数据处理流程、分析软件、使用步骤等,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集属于 dbGaP 研究,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据质量评估指标、数据完整性、准确性、偏差、样本量限制、人群代表性、测序质量、缺失数据情况等,源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 研究。关于该数据集的引用格式、许可协议、使用条款、数据共享政策、伦理审批信息等,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000401
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
dbGaP study (Case-Cohort, Case-Control, Cohort, Affected Sib Pairs, Exome Sequencing).
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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