NINDS 神经学正常对照样本库

该数据集来自 NINDS Repository,收录神经学正常个体的样本及表型数据,包括人口学、族裔及神经系统疾病排除信息,变量依据 Control Clinical Data Elements 表测量

omicsdi
浏览 7
基因组Genomics
National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NINDS) Repository Neurologically Normal Control Collection

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

NINDS 神经学正常对照样本库

NINDS Repository Neurologically Normal Control Collection 是由美国国家神经疾病与卒中研究所(NINDS)样本库建立并维护的一套神经系统正常个体对照样本与表型数据集合,英文全称为 National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NINDS) Repository Neurologically Normal Control Collection,在 omicsdi.org 上收录,主题标签为 Genomics,本站将其归入循环系统疾病 / 其他分类。该数据集的核心价值在于为神经系统疾病的基因发现研究提供对照参照:它收录了无神经系统疾病个体的 DNA、细胞系样本以及配套的表型数据,涵盖人口学、族裔和神经系统疾病排除等信息,变量依据 Control Clinical Data Elements 表进行测量。所有样本及表型与基因型数据均向学术界和产业界的研究人员开放,是神经遗传学研究中进行病例对照比较的重要基础资源。

【数据集背景】

NINDS 样本库于 2001 年 10 月建立,目标是开发标准化的、具有广泛用途的诊断数据及其他临床数据,并建立 DNA 与细胞系样本集合,以进一步推动神经系统疾病的基因发现。样本库的所有样本以及表型和基因型数据均向研究社区开放,包括学术机构和产业界的科学家。在神经系统疾病的基因发现工作中,缺乏合适的对照会使病例与背景之间的差异难以判定,因此一套来自无神经系统疾病个体的样本被认为是必不可少的,正是基于这一认识,NINDS 持续收集神经学正常个体的样本与表型数据,形成了本数据集。

【数据内容】

该数据集收录的是神经学正常个体的样本及表型数据。样本类型包括 DNA 和细胞系。表型数据所收集的信息包括人口学信息、族裔信息以及神经系统疾病的排除信息,相关变量依据 Control Clinical Data Elements 表进行测量。数据集中同时包含表型与基因型数据,并与样本一同提供。除上述内容外,源站未提供更细的变量条目、样本数量或分组构成说明。

【采集与来源】

数据由 NINDS 样本库组织收集,样本库的官方站点为 http://ccr.coriell.org/ninds/。样本来自被判定为不患神经系统疾病的个体,采集工作围绕建立神经学正常对照队列这一目标持续开展。源站描述提及截至 2007 年 6 月的进展状态,但该句在源站描述中未完整给出,因此具体的累计样本量或时间节点信息源站未提供。本数据集在 omicsdi.org 上发布与索引。

【适用场景】

该数据集主要适用于神经系统疾病的遗传学研究,尤其是需要对照组的基因发现与关联分析,研究者可将神经学正常个体的样本与表型数据作为对照,与神经系统疾病病例数据进行比较。由于样本与数据同时向学术与产业界开放,其适用对象包括高校、科研机构以及产业界的研发团队。此外,配套的人口学与族裔信息可用于对照分组与人群背景描述。除上述用途外,源站未提供其他具体应用场景的说明。

【使用方法】

样本及表型、基因型数据均可向研究社区申请获取,具体获取途径需通过 NINDS 样本库的官方站点了解。源站未提供本数据集的具体下载格式、访问流程、数据组织方式或配套分析工具等信息。

【质量与限制】

该数据集的一个明确特征是变量测量依据标准化的 Control Clinical Data Elements 表,这有助于不同研究之间的数据一致性。其定位为对照集合,本身不包含神经系统疾病病例。需要说明的是,源站描述中关于截至 2007 年 6 月的内容不完整,因此该数据集在此时间点的规模与覆盖情况无法确认;样本量、年龄范围、性别构成、族裔分布比例等具体指标源站未提供。使用者应注意对照个体的神经系统疾病排除依赖于所收集的表型信息,相关判定标准的细节源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可条款或使用限制说明。使用者在利用该数据集开展研究前,应通过 NINDS 样本库官方站点确认最新的数据使用政策与致谢要求。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/phs000004.v1.p1

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

NINDS样本库(http://ccr.coriell.org/ninds/)成立于2001年10月,目标是开发标准化、广泛适用的诊断及其他临床数据,并收集DNA和细胞系样本,以进一步推进神经系统疾病的基因发现。所有样本以及表型和基因型数据均向研究界开放,包括学术机构和产业界科学家。来自无神经系统疾病个体的样本集被认为对于神经系统疾病基因发现的推进至关重要。为实现这一目标,NINDS已经并正在收集神经系统正常个体的样本和表型数据。所收集的数据包括人口统计学、民族以及排除神经系统疾病的信息。变量使用对照临床数据元素表进行测量。截至2007年6月,共有2157份公开可用的样本,另有超过2000份样本将很快加入公开可用的生物材料收集。血液样本取自许多不同地点的神经系统正常、无亲缘关系的个体。

配偶、便利对照和人群对照均纳入本次采集。每位参与者均接受了详细的病史访谈,并针对阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化、共济失调、孤独症、双相障碍、脑动脉瘤、痴呆、肌张力障碍或帕金森病进行特定询问时,均无家族史。Folstein简易精神状态检查评分范围为26-30分,该数据可在部分个体中获取。所有参与者均接受了详细的家族史访谈,并特别确认无一级亲属患有以下任何疾病:肌萎缩侧索硬化、共济失调、孤独症、脑动脉瘤、肌张力障碍、帕金森病和精神分裂症。NINDS帕金森病、NINDS肌萎缩侧索硬化研究中使用了部分神经学正常的对照受试者

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。