特发性扩张型心肌病中甲基化组驱动的miRNA表达调控及其与心功能障碍的关系

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE309085

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数据说明

特发性扩张型心肌病（iDCM）是一种多因素疾病，其发病机制复杂，涉及多种分子机制。其中，表观遗传机制，包括DNA甲基化和微小RNA（miRNA）介导的调控，在决定疾病表型方面发挥重要作用。然而，iDCM中DNA甲基化组与miRNA转录组之间的相互作用在很大程度上仍未被探索。我们对iDCM患者和对照（CNT）供者的左心室（LV）组织样本进行了跨队列多组学整合分析。DNA甲基化谱分析使用Infinium MethylationEPIC BeadChip进行，而ncRNA-seq用于评估转录组变化。我们鉴定出7个miRNA的子集，其启动子区域既存在差异甲基化，其初级和成熟形式又存在差异表达。值得注意的是，其中两个参与纤维化通路的miRNA——hsa-miR-433-3p（r = 0.671，p < 0.01）和hsa-miR-493-5p（r = 0.585，p < 0.01）——似乎与左心室射血分数（LVEF）显著相关，LVEF是已确立的心脏功能超声心动图标志物。

重要的是，这两种miRNA均有预测或已验证的靶基因参与纤维化通路，提示DNA甲基化、miRNA表达、心脏重构与疾病表型之间可能存在关联。本研究加深了我们对塑造iDCM中miRNA转录组景观的表观遗传机制的理解，揭示了这些miRNA在心脏功能障碍和心肌纤维化中的潜在作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。