感染性心内膜炎患者外周血转录组学宿主内型鉴定 [pre-post_qx]

数据聚焦感染性心内膜炎患者前瞻性队列的外周血转录组学,用于识别宿主内型。源站未提供样本量、检测平台、分析流程与具体结论等信息,因此可支持的研究用途需以源站进一步说明为准(来源 omicsdi.org)

omicsdi
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基因组分类Genomics
Identification of host endotypes using peripheral blood transcriptomics in a prospective cohort of patients with endocarditis [pre-post_qx]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-28

资源简介

感染性心内膜炎患者外周血转录组学宿主内型鉴定 [pre-post_qx]

该数据集英文名为 Identification of host endotypes using peripheral blood transcriptomics in a prospective cohort of patients with endocarditis [pre-post_qx],来源于 omicsdi.org,在站内归入心血管系统疾病 / 其他分类,主题标签为 Genomics。从名称与来源描述看,该数据围绕感染性心内膜炎患者的前瞻性队列,利用外周血转录组学数据识别宿主内型(host endotypes),并带有 pre-post_qx 标识,提示数据可能涉及干预或时间点前后对照的设计。源站未提供样本量、检测平台、分析流程与具体结论等信息,因此该数据集可支持的研究用途需以源站进一步说明为准。以下依据现有信息对该数据集作介绍。

【数据集背景】

感染性心内膜炎是一种累及心脏内膜及瓣膜的感染性疾病,其临床表现与宿主免疫反应存在较大异质性。该数据集以宿主内型识别为核心目标,采用外周血转录组学作为主要数据维度,在感染性心内膜炎患者的前瞻性队列中开展研究。名称中的 pre-post_qx 标识提示数据可能包含干预或时间点前后对照的设计元素,但具体设计细节源站未提供。

【数据内容】

该数据集属于基因组学主题,核心内容为感染性心内膜炎患者外周血的转录组学数据,用于宿主内型的识别。数据名称中的 pre-post_qx 标识提示可能包含前后对照或干预相关的时间点信息。样本量、检测平台、基因表达矩阵的具体组织形式、注释信息以及分析流程等,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 omicsdi.org,源站描述与数据集英文名一致,均指向感染性心内膜炎前瞻性队列的外周血转录组学研究。站内分类为心血管系统疾病 / 其他。关于采集地点、采集时间、纳入排除标准、伦理审批信息以及原始数据的具体来源机构,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可用于感染性心内膜炎宿主内型识别相关的研究,例如外周血转录组层面的宿主分型探索、前瞻性队列中的转录组特征分析,以及带 pre-post_qx 设计的前后对照研究。由于源站未提供样本量、检测平台与分析流程等信息,具体可支持的研究用途需以源站进一步说明为准。

【使用方法】

该数据集的使用需结合源站 omicsdi.org 的进一步说明。数据下载方式、文件格式、预处理要求、分析流程与推荐工具等,源站未提供。使用者在开展分析前应查阅源站的相关说明与文档。

【质量与限制】

现有信息未提供样本量、检测平台、数据质控指标与分析结论,因此无法对该数据集的质量作出具体评价。该数据集聚焦于感染性心内膜炎这一特定疾病背景下的外周血转录组学,其适用范围受疾病与样本类型限制。pre-post_qx 标识所对应的具体设计含义,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用方式、许可协议与使用条款,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应查阅 omicsdi.org 源站的相关说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/project/PRJNA1003147

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Identification of host endotypes using peripheral blood transcriptomics in a prospective cohort of patients with endocarditis [pre-post_qx]

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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