不同侧支血流指数CFI个体单核细胞表达数据

该数据集来源于NCBI GEO,收录不同侧支血流指数(CFI)个体外周血单核细胞的基因表达谱数据,采用微阵列表达谱技术,平台为GPL571,物种为人类(9606)

geo
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基因组分类Expression profiling by arrayGPL5719606
GSE7638: Expression data from monocytes of individuals with different collateral flow index CFI

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

不同侧支血流指数CFI个体单核细胞表达数据

GSE7638 是一个来源于 NCBI GEO 的基因表达谱数据集,主题为不同侧支血流指数(CFI)个体外周血单核细胞的表达数据。该数据集旨在利用外周血单核细胞寻找广泛生长的冠状动脉侧支循环相关的标志基因,采用微阵列表达谱技术,平台为 GPL571,物种为人类(9606)。数据集由 Pascal、Meier 提交,发布时间为 Apr 26 200,包含 1 个文件,样例文件为 GSE7638_series_matrix.txt.gz。本站将其归类于循环系统疾病 / 其他。整体而言,该数据集提供了从外周血单核细胞角度研究冠状动脉侧支循环形成的表达谱资源,可供相关研究者在合规前提下下载并开展分析。

【数据集背景】

该数据集关注冠状动脉侧支循环的形成机制。源站描述指出,其研究思路是利用外周血单核细胞来识别与广泛生长的冠状动脉侧支循环相关的标志基因。侧支血流指数(CFI)被用作区分个体的依据,数据集收录了不同 CFI 个体的单核细胞表达数据。本站分类将其归入循环系统疾病 / 其他,主题标签包括 Expression profiling by array、GPL571 和 9606,分别对应表达谱芯片技术、芯片平台和人类物种。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE7638_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。内容为不同侧支血流指数个体外周血单核细胞的基因表达谱数据,采用微阵列表达谱技术,平台为 GPL571,物种为人类(9606)。源站标题为“Expression data from monocytes of individuals with different collateral flow index CFI”。除上述信息外,源站未提供样本数量、分组细节、基因数量或具体指标等进一步内容。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,即 NCBI GEO 数据库。作者为 Pascal、Meier,发布时间为 Apr 26 200。源站描述说明,该数据通过外周血单核细胞寻找广泛生长的冠状动脉侧支循环的标志基因。关于样本采集流程、伦理审批、受试者纳入标准等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕冠状动脉侧支循环形成与单核细胞基因表达关系的研究,例如在不同 CFI 个体之间比较表达谱、探索候选标志基因,以及作为微阵列表达谱分析的教学或方法验证素材。由于采用 GPL571 平台且物种为人类,也可用于与该平台相关的表达数据整合分析。具体分析目标需结合源站信息自行确定,源站未提供推荐的分析流程或结论。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE7638_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入。关于文件内部的具体字段含义、注释信息及预处理步骤,源站未提供,需结合平台 GPL571 的相关说明自行核查。

【质量与限制】

该数据集仅有 1 个文件,样本规模、分组平衡性、数据完整性等质量指标源站未提供。由于缺少样本量、临床变量和预处理细节,使用时应谨慎评估其适用性。数据集发布时间为 Apr 26 200,具体年份信息不完整,源站未提供更新记录或版本说明。任何分析结论均应结合原始数据核查,避免超出数据本身的支持范围。

【引用与许可】

作者为 Pascal、Meier,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用格式、许可条款和使用限制,源站未提供,使用前应查阅 NCBI GEO 原始页面及相关政策。

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE7638

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

利用外周血单核细胞识别广泛生长的冠状动脉侧支循环的标志基因。我们使用微阵列技术详细描绘了侧支化过程中基因表达的全局程序,并在此过程中识别出不同类别的差异调控基因。关键词:观察性研究

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

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