冠状动脉侧支动脉生长中的循环细胞

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE7547

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：侧支动脉生长，也称为动脉生成，发生于主要动脉狭窄或闭塞时。迄今为止，旨在刺激患者动脉生成以达到治疗目的的尝试尚未成功。实验模型表明，循环细胞协调动脉生成。在人类中，动脉生成反应存在很大的异质性。我们假设，动脉生成反应良好者（GARs）与动脉生成反应不良者（BARs）在循环细胞的基因表达谱上存在差异，从而揭示出刺激动脉生成的潜在新治疗策略。方法：共45例因单支冠状动脉病变计划接受经皮冠状动脉介入治疗（PCI）的患者接受了冠状动脉内侧支血流指数（CFI）测量，以区分GARs（CFI>0.21）和BARs（CFI≤0.21）。从外周血中采集单核细胞和CD34+干细胞。部分单核细胞进一步处理以获得活化的单核细胞和巨噬细胞。对全部四种细胞类型进行了全基因组转录组分析。

结果：LPS刺激的单核细胞显示，GARs与BARs之间有244个基因差异表达（错误发现率<0.05）。巨噬细胞基因表达与受刺激的单核细胞相关，而静息单核细胞和干细胞未显示差异基因表达。来自GARs的受刺激单核细胞在若干干扰素和凋亡相关基因中表现出强烈减弱的反应，这在蛋白质水平上得到了证实。结论：来自GARs和BARs的循环细胞在刺激后的基因表达谱上存在明显差异。GARs中干扰素和凋亡基因表达降低可能为刺激侧支动脉生长提供新的治疗途径。关键词：疾病状态分析，应激反应分析，自然防御机制分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。