高血糖诱导内皮功能障碍中的microRNA

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE74296

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

高血糖是糖尿病前期和2型糖尿病(T2DM)的标志性特征，会增加微血管和大血管并发症的风险，如糖尿病视网膜病变、糖尿病肾病(微血管并发症)，以及外周血管疾病、脑血管疾病和心血管疾病(大血管并发症)。内皮细胞在两种情况下均受到影响。在本研究中，我们考察了人脐静脉内皮细胞(HUVECs)在不同葡萄糖处理浓度(5mM、10mM、25mM和40mM葡萄糖)及不同时间间隔(6、12、24和48小时)下的miRNA表达变化。miRNA微阵列结果显示，高血糖诱导的内皮功能障碍与miRNA表达之间存在相关性。计算机预测表明，以下通路：肌动蛋白细胞骨架调控、PI3K-Akt信号通路、细胞凋亡、神经营养因子信号通路和胰岛素信号通路，在高血糖期间发生失调。大多数通路与细胞凋亡相关。10种miRNA(miR-26a-5p、-26b-5p、29b-3p、29c-3p、125b-1-3p、-130b-3p、-140-5p、-221-3p、-192-5p和-320a)随葡萄糖处理浓度升高而表达增加。

miR-26a-5p、-29b-3p、-140-5p、-221-3p和-192-5p参与内皮细胞凋亡。我们的研究揭示，具有已知mRNA靶标（BCL2和MCL1）的miRNA（miR-29b-3p和-192-5p）的表达模式与其各自的靶mRNA呈负相关。因此，这些miRNA可能参与高血糖引起的内皮功能障碍。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。