猪主动脉高血压重塑中TGFβ信号传导的基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE7115

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数据说明

本研究采用猪主动脉缩窄模型，探讨早期高血压性血管重塑过程中基因表达的调控。在持续性高血压（平均动脉压>150mmHg）2周后，收集缩窄部位近端（高压）和远端（低压）的主动脉节段。利用猪10K寡核苷酸芯片对两个主动脉区域进行基因表达谱分析，结果显示相对于全基因组，细胞骨架基因表达下调，细胞外区域基因表达上调。通过基因组数据库检索转化生长因子-β（TGFβ）调控元件（TCE），发现因高血压而发生表达改变的基因中，19%含有推测的TCE。实时PCR和微阵列分析显示TGFβ1、TGFβ2、TGFβ3以及骨形态发生蛋白（BMP）2和4的表达均无变化，然而，磷酸化SMAD2（TGFβ信号传导的指标）和磷酸化SMAD1/5/8（BMP信号传导的指标）的免疫组化染色显示，在缩窄动物的近端主动脉节段中阳性染色细胞百分比最高。

对于TGFβ信号传导，这一增加与假手术对照组相比具有显著差异。Western blot分析显示，总TGFβ1蛋白水平在治疗或主动脉段方面没有差异。免疫组化显示，闭塞动物近端段中潜伏相关肽的蛋白水平降低。综上所述，这些结果表明TGFβ的激活，而非表达的改变，可能是调节早期高血压血管重塑的主要机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。