GSE64486：川崎病动脉炎的转录组

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE64486

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

背景：川崎病（KD）是一种病因疑为感染性的儿童疾病，可引起中等大小肌性动脉炎，最严重的是累及冠状动脉。目前尚无单一诊断性检测方法，阻碍了早期诊断和治疗。约25%未经治疗的患者会发展为冠状动脉疾病，接受静脉注射丙种球蛋白治疗但无应答的儿童也处于高风险。亚急性/慢性动脉炎和管腔肌纤维母细胞增生是川崎病冠状动脉在发病第二周后、中性粒细胞性坏死性动脉炎消退后发生的病理过程。导致亚急性/慢性动脉炎的具体免疫通路失调此前尚不清楚，阻碍了为对静脉注射丙种球蛋白治疗无应答的患者开发有效的免疫调节疗法。方法与结果：对川崎病（n=8）和儿童对照（n=7）的冠状动脉组织进行了深度RNA测序，揭示了1074个差异表达的mRNA。涉及辅助性T细胞、细胞毒性T淋巴细胞、树突状细胞和抗原呈递的分子通路失调最为显著。

免疫球蛋白和I型干扰素刺激基因显著上调。80个编码分泌蛋白的上调细胞外基因是川崎病动脉炎的候选生物标志物。结论：川崎病冠状动脉组织中的免疫转录谱主要由辅助性T细胞和细胞毒性淋巴细胞介导，并具有抗病毒免疫反应的特征，如I型干扰素刺激基因表达。这是关于川崎病冠状动脉转录组的首次报告，识别出了特定的失调免疫反应通路，可为川崎病动脉炎新疗法和生物标志物的开发提供信息，并为未来的病因学研究提供方向。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。