可变体重囊性纤维化敲除小鼠的肠道表型

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE5715

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

囊性纤维化跨膜传导调节因子（Cftr）敲除小鼠表现出低体重和肠道疾病的临床特征，这使得在受控环境中评估这些表型之间的相互关联性成为可能。为了识别影响CF小鼠体重的肠道改变，研究测量了隐窝-绒毛轴高度、杯状细胞增生和肥大细胞浸润的组织学表型，评估了心脏血样，并对12周龄（C57BL/6xBALB）F2 Cftrtm1UNC小鼠和呈现不同体重范围的非CF小鼠完成了回肠基因表达谱分析。在CF小鼠中，隐窝-绒毛轴高度随体重增加而降低，而对照组小鼠则无此现象。CF小鼠肠道黏膜下层和肌层外层的杯状细胞增生和肥大细胞浸润被确定为与体重无关。研究发现，CF小鼠的血甘油三酯水平显著低于对照组小鼠（p = 3.02 x 10-5），但不依赖于CF小鼠的体重。

通过表达谱分析，与未患CF的对照组相比，CF小鼠中DNA复制和脂质代谢相关基因属于发生改变的基因之列；而在体重位于第25百分位和第75百分位的CF小鼠样本之间，未检测到基因表达差异。本研究表明，Cftr的缺失导致CF肠道形态学改变，其程度与CF小鼠的体重相关，而在此模型中，CF相关的血甘油三酯水平变化及肠道基因表达谱变化并不依赖于体重。关键词：疾病状态分析

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。