GSE48424：重度子痫前期新型血液循环生物标志物
该数据集来自 NCBI GEO，标题为重度子痫前期新型血液循环生物标志物，包含 1 个文件 GSE48424_series_matrix.txt.gz，采用表达谱芯片平台 GPL6480，物种为 9606（人类）
基本信息
资源简介
GSE48424：重度子痫前期新型血液循环生物标志物
GSE48424 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集，标题为“重度子痫前期新型血液循环生物标志物”，聚焦于重度子痫前期这一妊娠期胎盘疾病的血液循环生物标志物研究。该数据集归类于循环系统疾病及其他类别，包含 1 个数据文件 GSE48424_series_matrix.txt.gz，采用表达谱芯片技术，平台编号为 GPL6480，物种为人类（9606）。数据集由 Julien、Textoris 提交，发布时间为 201 年 6 月 28 日。整体而言，该数据集为研究者提供了一个可直接下载的系列矩阵文件，用于探索重度子痫前期相关的基因表达特征与潜在循环标志物。
【数据集背景】
子痫前期是一种胎盘疾病，以孕妇高血压和蛋白尿为特征，与较高的母婴发病率相关。然而，能够预测子痫前期预后的循环生物标志物仍然缺乏。该数据集正是围绕“重度子痫前期新型血液循环生物标志物”这一主题组织，旨在为相关生物标志物的发现与验证提供表达谱层面的数据基础。源站描述明确指出了这一临床背景与研究缺口，即现有条件下可用于预测子痫前期预后的循环标志物不足。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件，文件样例为 GSE48424_series_matrix.txt.gz，属于系列矩阵格式的压缩文件。主题标签显示其数据类型为表达谱芯片（Expression profiling by array），平台为 GPL6480，物种为人类（9606）。文件数量为 1，意味着该数据集以单一压缩包形式提供全部系列矩阵内容。源站未提供样本数量、分组设计、具体基因数量或差异表达结果等更细粒度的信息。
【采集与来源】
数据集来源于 NCBI GEO（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“Severe preeclampsia: new blood circulating biomarkers”。作者为 Julien、Textoris，发布时间为 201 年 6 月 28 日。本站将其分类为循环系统疾病 / 其他。除上述来源信息外，源站未提供具体的样本采集地点、采集时间、伦理审批信息或临床队列构成等细节。
【适用场景】
基于其主题与数据类型，该数据集适用于围绕重度子痫前期血液循环生物标志物开展的表达谱分析工作，例如对系列矩阵文件进行基因表达层面的探索、标志物候选筛选的方法学验证，以及与其他子痫前期相关表达谱数据的比较研究。其循环系统疾病分类也提示可用于妊娠期高血压相关疾病的数据整合分析。源站未提供该数据集的具体适用分析流程或已验证的分析结论。
【使用方法】
使用该数据集时，首先下载数据文件 GSE48424_series_matrix.txt.gz，按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入后续分析流程。由于文件为系列矩阵格式，读取后应关注其矩阵结构、样本标识与表达值编码方式，确保与所用分析工具兼容。源站未提供额外的预处理步骤或标准化参数说明。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件，数据组织相对简单，便于直接获取与读取。其平台为 GPL6480，物种为人类，主题标签明确。但源站未提供样本量、临床分组、质控指标、缺失值情况或批次信息等质量相关细节，因此在未进一步核查文件内容前，不宜对其数据质量与统计效力作出判断。此外，发布时间标注为“Jun 28 201”，年份信息不完整，源站未提供更明确的版本更新记录。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Julien、Textoris，来源站为 NCBI GEO。源站未提供具体的引用文献、DOI、许可协议或使用条款信息。使用者在引用或再利用该数据集前，应自行查阅 NCBI GEO 页面上的原始记录以确认引用格式与使用条件。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE48424
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
背景：子痫前期（PE）是一种以孕妇高血压和蛋白尿为特征的胎盘疾病，与较高的母婴发病率相关。然而，目前缺乏能够预测PE预后的循环生物标志物。方法：本研究纳入38名女性，包括19例PE患者（13例重度PE和6例非重度PE）以及19名孕龄匹配的正常妊娠对照。我们检测了PE患者组和血压正常对照组的凝血途径、内皮反应、微粒释放及循环基因表达。结果：凝血途径、内皮激活及循环微粒相关标志物的检测能够区分PE与正常妊娠，但不足以区分重度与非重度PE。PE患者还表现出与对照女性不同的特异性转录程序，且重度与非重度PE之间存在细微差异。对PE中上调特征的功能注释突出了与核糖体和补体相关的两个主要功能。
重要的是，我们发现8个基因在重度子痫前期中特异性上调。在这些基因中，与对照组和非重度子痫前期患者相比，重度子痫前期患者的VSIG4表达显著增加。结论：利用血液样本的转录特征，我们确定了编码雌激素受体的基因作为重度子痫前期的潜在诊断标志物。此外，该基因的测定可能改善重度子痫前期的预后评估。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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