法洛四联症婴儿心肌非编码RNA表达谱[miRNA profiling]

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE35490

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数据说明

这是首次对先天性心脏缺陷中非编码RNA表达进行表征的报告。非编码RNA表达的显著变化反映了细胞生物学的基本改变，可能影响发育重要基因的表达、转录剪接和翻译，并可能导致心脏缺陷。非编码RNA（ncRNA），尤其是microRNA，对于维持发育中脊椎动物心脏稳定性的重要性近来已逐渐明确。然而，关于发育异常的人类心脏中ncRNA的表达模式所知甚少。我们检测了16例无22q11.2缺失的非综合征型法洛四联症（TOF）婴儿、3例胎儿心脏样本和8例正常发育婴儿右心室心肌中microRNA和小核仁RNA（snoRNA）的表达。我们发现，与正常发育的对照受试者相比，TOF患儿心肌中有61种microRNA和135种snoRNA的表达发生显著改变。TOF心肌中ncRNA的表达模式与胎儿心肌中的表达模式极为相似，尤其是snoRNA。

表达发生改变的microRNA的潜在靶点在對心脏发育具有重要意义的基因网络中富集。我们整理了一份已知对心脏发育至关重要的229个基因的列表，发现其中44个基因在TOF心肌中相对于正常发育心肌的表达发生了显著变化。这44个基因与33个microRNA呈显著负相关，而这些microRNA的表达也均发生了显著变化。snoRNA的主要功能是靶向核糖体RNA和剪接体RNA的特定核苷酸，对其进行生化修饰。差异表达snoRNA所靶向的核苷酸集中在28S和18S核糖体RNA以及两种剪接体RNA（U2和U6）上。此外，在TOF患儿的心肌中，我们观察到剪接变

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。