多组织转录组揭示运动与GLP-1激动剂协同改善db/db小鼠糖尿病表型的机制

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE341948

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数据说明

2型糖尿病（T2DM）涉及多器官协调的代谢功能障碍，然而药物与运动联合干预的系统层面效应仍不明确。雄性db/db小鼠接受司美格鲁肽、高强度间歇训练（HIIT）或两者联合干预八周。对心脏、肾脏、肝脏、海马和骨骼肌进行了多器官bulk RNA-seq，并结合qPCR验证和CellChat分析。联合治疗在减少摄食量、体重和空腹血糖方面效果最为显著。转录组反应具有器官依赖性，在骨骼肌和肝脏中最为明显。在联合治疗下，海马和肝脏中的DEGs相对于单一干预不再达到阈值，这与qPCR显示海马Glp1r和肝脏Plpp7未发生变化一致，而心脏、肾脏和骨骼肌则保持一致的调控，并进一步降低心脏Cyp2ab1及肾脏/肌肉Apoa1。跨器官分析识别出PPARα–Plin4轴的协调调控及脂质代谢通路的抑制，并经qPCR证实。

器官间网络分析显示，联合治疗下通讯数量增加但相互作用强度降低。这些发现表明器官特异性转录适应对HIIT与司美格鲁肽联合干预的响应。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。