GSE336673：病毒转录调控因子通过多样机制广泛重编程宿主通路

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE336673

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

病毒转录调控因子（vTRs）重编程宿主基因调控网络，以促进复制、持续感染和免疫逃逸。尽管已在人类病毒中鉴定出数百种vTRs，但它们如何重塑宿主通路仍不清楚。在此，我们通过多种功能实验系统分析了来自不同人类病毒的95种vTRs。vTRs通过多种机制扰动免疫、细胞增殖/死亡及信号通路；部分直接结合DNA，部分协同或拮抗人类转录因子（hTFs），还有一些重塑染色质。vTRs可作为激活因子或抑制因子，并招募与hTFs相似但不完全相同的蛋白质谱系。这些发现揭示vTRs是多功能的转录调节因子，它们汇聚于保守的宿主“压力点”，同时在不同通路上呈现多样化，以促进病毒复制和持续感染。值得注意的是，许多vTR失调自身免疫、神经和心血管风险位点内的基因，揭示了与疾病的潜在机制联系。总之，我们提供了一个大规模资源，用于理解和靶向病毒对人类转录的调控。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。