豹纹守宫心脏心室再生数据集 GSE326865

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE326865

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

在哺乳动物中，心脏损伤通常导致瘢痕形成和心血管功能减退。相比之下，一些硬骨鱼类和蝾螈能够替换受损的心脏组织并恢复整体功能。然而，对于大多数物种而言，人们所知甚少。在此，我们研究了能够进行多组织再生的羊膜动物——豹纹守宫（Eublepharis macularius）的心脏自我修复能力。为制造心脏损伤，我们将经液氮冷却的金属探针直接置于心室上。结果造成约20%心室的冷冻损伤。心脏冷冻损伤诱导了局部心脏细胞死亡，随后损伤邻近的心肌细胞和非心肌细胞增殖增加。至100天时，心室心肌的组织学结构近乎完全恢复。超声心动图和侵入性血流动力学监测表明，整体心脏功能在该时间范围内得以恢复，验证了心肌的功能性替换。

为探究其分子基础，我们对损伤邻近组织进行了批量RNA测序，发现其他心脏再生物种共有的许多分子机制，包括参与心脏发育、糖酵解和细胞外基质沉积的基因，在壁虎中同样保守。综上所述，这项工作将心脏再生的比较框架扩展至爬行动物，并表明替换缺失或受损心肌细胞的能力在超过3.5亿年的进化历程中得以共享。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。