糖尿病小鼠妊娠胚胎心脏发育差异基因表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE32078

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

先天性心脏缺陷（CHD）是糖尿病母亲后代中最常见的缺陷之一。母体糖尿病与CHD之间存在明确的关联；然而，其潜在的分子机制仍不清楚。我们假设母体糖尿病会影响调控心脏基本发育过程的早期发育基因的表达，从而导致CHD的发病。我们利用寡核苷酸微阵列分析了糖尿病小鼠和对照小鼠胚胎发育中心脏的全基因组表达谱。微阵列分析显示，与各自的对照组相比，在E13.5或E15.5的实验胚胎心脏中，共有878个基因的表达水平呈现出超过1.5倍的变化。通过实时逆转录聚合酶链反应进一步检测了在发育心脏中差异表达基因的表达模式。在糖尿病妊娠的胚胎中，参与发育心脏中细胞凋亡、增殖、迁移和分化等多个分子信号通路的若干基因出现了差异表达。

研究结论认为，参与心脏发育的若干基因表达的改变可能促成糖尿病母亲后代先天性心脏病的发生。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。