心肌脂肪变性小鼠模型中胞内脂滴过度积累损害窦房结功能

该数据集来自 NCBI GEO,标题为心肌脂肪变性小鼠模型中胞内脂滴过度积累损害窦房结功能,包含 1 个文件 GSE320205_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为 GPL19057

geo
浏览 6
基因组分类GPL1905710090
GSE320205: Excess accumulation of intracellular lipid droplet impairs sinoatrial function in a mouse model of myocardial steatosis

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

心肌脂肪变性小鼠模型中胞内脂滴过度积累损害窦房结功能

Excess accumulation of intracellular lipid droplet impairs sinoatrial function in a mouse model of myocardial steatosis

该数据集来自 NCBI GEO,标题为心肌脂肪变性小鼠模型中胞内脂滴过度积累损害窦房结功能,包含 1 个文件 GSE320205_series_matrix.txt.gz,属于高通量测序表达谱数据,物种为小鼠(10090),平台为 GPL19057。数据可用于研究心肌脂肪变性中脂滴积累对窦房结自律性的影响,支持差异表达分析与功能机制探索(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Feb 23 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的:窦房结(SAN)功能障碍在肥胖和糖尿病中常见,并与心血管发病率和死亡率增加相关。心脏脂肪变性以心肌细胞中过度的胞内脂滴(LD)积累为特征,在这些代谢紊乱中常见,但其对SAN功能障碍的直接贡献仍不清楚。我们研究了胞内LD积累是否损害SAN自律性。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL19057、10090。本站分类:循环系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE320205

【使用注意】

· 源站最后修改于 Oct 23 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

免费样本无法满足模型训练要求?千方提供经三甲医院脱敏、带病理回证与专家标注的商业级专病数据集。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE320205

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的:窦房结(SAN)功能障碍在肥胖和糖尿病中常见,并与心血管发病率和死亡率增加相关。心脏脂肪变性以心肌细胞内脂滴(LD)过度蓄积为特征,在这些代谢性疾病中较为常见,但其对SAN功能障碍的直接作用尚不清楚。我们研究了细胞内LD蓄积是否损害SAN自律性。方法与结果:研究了心肌细胞特异性过表达perilipin 2(PLIN2)的转基因小鼠(TG)以及共表达PLIN2和激素敏感性脂肪酶(HSL)的双转基因小鼠(DTG)。TG小鼠SAN肌细胞中表现出明显的LD蓄积,同时心电图(ECG)显示R–R间期延长且高度变异。SAN–心房制备的光学Ca²⁺标测显示,TG小鼠的主导起搏位点向周边结区和结外区域移位。分离的TG SAN肌细胞表现出肌浆网Ca²⁺含量降低、局部Ca²⁺释放(LCRs)减弱,以及细胞内和线粒体活性氧(ROS)水平升高。

相比之下,线粒体和肌浆网超微结构未发生改变,整体基因表达谱得以保持,仅PLIN2过表达例外。通过HSL共表达使细胞内脂滴蓄积正常化,可防止心电图、窦房结自律性、细胞内Ca²⁺处理和ROS水平的异常,尽管PLIN2持续过表达。本研究受限于仅使用雄性小鼠,且未直接检验ROS升高对观察到的窦房结功能障碍的因果贡献。结论:仅细胞内脂滴蓄积即足以改变细胞内Ca²⁺处理并损害窦房结自律性。通过HSL共表达使细胞内脂滴蓄积正常化可防止窦房结功能障碍,支持细胞内脂滴蓄积在起搏器功能障碍中的因果作用。这些发现

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?

公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。