E11.5 鳃弓 RNA-seq:对照组与 Ehmt1/2 神经嵴敲除组
数据可用于分析神经嵴分化、替代命运通路及心脏肌肉、内皮和肌纤维母细胞谱系相关基因表达,支持差异表达与基因集富集分析(来源 NCBI)

基本信息
资源简介
E11.5 鳃弓 RNA-seq:对照组与 Ehmt1/2 神经嵴敲除组
E11.5 Branchial Arches RNA-seq from controls and Ehmt1/2 neural crest knockouts
该数据集为 E11.5 胚胎鳃弓组织的 RNA-seq 表达谱数据,包含 3 个对照组(Ehmt1+/+、Ehmt2+/+、Rosa26 TdTomato/+、Wnt1-cre)和 3 个双敲除组(Ehmt1f/f、Ehmt2f/f、Rosa26 TdTomato/+、Wnt1-cre)样本,用于比较神经嵴中 GLP 和 G9a 缺失后的转录组变化。数据可用于分析神经嵴分化、替代命运通路及心脏肌肉、内皮和肌纤维母细胞谱系相关基因表达,支持差异表达与基因集富集分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Feb 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):GLP 和 G9a 抑制神经嵴中的替代命运通路。对 3 个对照(Ehmt1+/+、Ehmt2+/+、Rosa26 TdTomato/+、Wnt1-cre)和 3 个 DKO(Ehmt1f/f、Ehmt2f/f、Rosa26 TdTomato/+、Wnt1-cre)E11.5 胚胎的转录谱分析显示,DKO 中替代命运程序显著上调,但与细胞增殖、凋亡或迁移相关的基因集表达未见差异。对照胚胎富集与神经嵴分化和成骨细胞分化正调控相关的基因。而 DKO 显著富集与心脏肌肉、内皮和肌纤维母细胞谱系相关的基因。综上,我们的 RNA-seq 数据表明,神经嵴群体中 GLP 和 G9a 的缺失导致替代命运基因的异常表达。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL32159、10090。本站分类:循环系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318813
【使用注意】
· 源站最后修改于 Aug 10 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
GLP和G9a抑制神经嵴中的替代命运通路。对3个对照胚胎(Ehmt1+/+、Ehmt2+/+、Rosa26 TdTomato/+、Wnt1-cre)和3个双基因敲除(DKO)胚胎(Ehmt1f/f、Ehmt2f/f、Rosa26 TdTomato/+、Wnt1-cre)在E11.5阶段的转录谱分析显示,DKO中替代命运程序显著上调,但与细胞增殖、凋亡或迁移相关的基因集表达未见差异。对照胚胎中富集与神经嵴分化及成骨细胞分化正调控相关的基因。相比之下,DKO中显著富集与心肌、内皮和肌成纤维细胞谱系相关的基因。综上所述,我们的RNA-seq数据表明,神经嵴群体中GLP和G9a的缺失导致替代命运基因的异常表达。
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