先天性膈疝中的microRNAs：产前与围产期生物标志物及分子通路改变

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE316871

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数据说明

背景：先天性膈疝（CDH）以膈肌缺损为特征，导致腹腔器官疝入胸腔、肺受压及肺发育受损，常引起肺动脉高压和肺发育不良。超声和MRI等产前影像技术可提供解剖学预后预测指标，但其局限性使得有必要寻找新型生物标志物以提高预后准确性。目的：本研究旨在识别能够区分CDH妊娠与健康对照的独特母体、胎儿及新生儿循环microRNA（miRNA），并评估其作为疾病严重程度标志物的潜力。研究设计：我们开展了一项前瞻性研究，纳入合并CDH的妊娠及健康对照的孕晚期母血、羊水、脐血及新生儿血样本。采用RNA测序分析miRNA表达，并通过随机森林分析识别区分CDH存活者与非存活者的miRNA。进行通路富集分析以探讨差异表达miRNA的生物学相关性。

结果：在所有样本类型中，CDH与对照样本之间均观察到显著的miRNA表达差异。在婴儿血液中，CDH病例有148个miRNA上调，36个miRNA下调。通路分析显示，CDH中失调的miRNA靶向与蛋白质结合、转录调控相关的通路，以及与肺动脉高压和肺发育不良相关的信号通路。随机森林分析识别出母血中的miRNA（miR-7850-5p_L-1R+2、miR-942-3p和miR-197-3p）可将CDH存活者与非存活者区分开来，受试者工作特征曲线下面积为1.0。结论：母血中的循环miRNA是预测CDH结局的有前景的生物标志物。婴儿血液中的miRNA为危重

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。