单核转录组揭示参与心脏重构的浦肯野细胞淋巴管内皮样亚群

该数据集来自 NCBI GEO(GSE313716),包含成年雄性小鼠心脏单核转录组测序的表达谱数据,用于研究浦肯野细胞的分子与细胞特征

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基因组分类GPL2424710090
GSE313716: Single-nucleus transcriptomics uncovers a lymphatic endothelial cell-like subpopulation of Purkinje cells involved in cardiac remodeling

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

单核转录组揭示参与心脏重构的浦肯野细胞淋巴管内皮样亚群

Single-nucleus transcriptomics uncovers a lymphatic endothelial cell-like subpopulation of Purkinje cells involved in cardiac remodeling

该数据集来自 NCBI GEO(GSE313716),包含成年雄性小鼠心脏单核转录组测序的表达谱数据,用于研究浦肯野细胞的分子与细胞特征。数据覆盖生理条件及心肌梗死后浦肯野细胞的异质性,可识别标准型、过渡型和淋巴管内皮细胞样浦肯野细胞三类亚群,并支持研究其在心肌梗死后调控心肌细胞存活、细胞外基质形成、细胞迁移和血管新生等潜在功能,以及 Reelin 作为淋巴管内皮细胞样浦肯野细胞标志物的作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Dec 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):浦肯野细胞是特化的心肌细胞,协调快速电传播以实现心脏同步收缩。尽管这些细胞在一个多世纪前就已被描述,但其在生理条件下和心肌梗死后的分子与细胞特征尚未被完全理解。在此,我们展示单核转录组测序在成年雄性小鼠中鉴定出三种类型的浦肯野细胞,包括标准型、过渡型和淋巴管内皮细胞样浦肯野细胞。重要的是,浦肯野细胞具有膜下囊泡,并表现出潜在功能,尤其是在心肌梗死后,包括调控心肌细胞存活、细胞外基质形成、细胞迁移和血管新生。Reelin 是一种分泌蛋白,被发现是淋巴管内皮细胞样浦肯野细胞的标志物。来自诱导的浦肯野-li

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:循环系统疾病/其他。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE313716

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 28 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

浦肯野细胞是一种特化的心肌细胞,协调快速电信号传导以实现心脏同步收缩。尽管这些细胞在一个多世纪前就已被描述,但其在生理条件下及心肌梗死后的分子和细胞特征尚未被完全了解。本研究表明,单核转录组测序在成年雄性小鼠中鉴定出三种类型的浦肯野细胞,包括标准型、过渡型和淋巴管内皮细胞样浦肯野细胞。重要的是,浦肯野细胞具有膜下囊泡,并表现出潜在功能,尤其是在心肌梗死后,包括调节心肌细胞存活、细胞外基质形成、细胞迁移和血管生成。Reelin是一种分泌蛋白,被发现是淋巴管内皮细胞样浦肯野细胞的标志物。来自诱导性浦肯野样细胞的Reelin不仅能增强心肌细胞存活,还能抑制成纤维细胞中缺氧诱导的纤维化相关基因表达。

这些发现表明,除了已知的对电生理特性的调节作用外,浦肯野细胞还发挥着多方面的作用,并参与心肌梗死后的心脏重塑。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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