肝脏调控弹性假黄瘤病异位钙化数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE312469

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

弹性假黄瘤（PXE）是一种由Abcc6基因功能缺失引起的罕见疾病，以包括心脏和血管系统在内的多种组织发生异位钙化为特征。PXE中异位钙化的生理性原因仍不清楚。我们建立了一个稳健的异位心脏钙化模型，其中Abcc6基因全身缺陷的动物在心脏损伤后3天内出现心脏广泛矿化。为了深入了解PXE中异位心脏钙化的潜在机制，我们构建了心肌细胞特异性敲除Abcc6的动物，但未观察到任何钙化，提示Abcc6以心肌细胞非自主方式发挥作用以导致钙化。已知炎症在介导心血管系统异位钙化中发挥关键作用，但将野生型动物的骨髓移植到Abcc6缺陷动物中并未挽救钙化表型。然而，肝脏中Abcc6的组织特异性敲除足以引起损伤后心脏钙化，提示肝脏在驱动远处组织异位钙化中发挥作用。

对全身性Abcc6缺陷或肝脏特异性缺失Abcc6的动物进行代谢组学和基因表达分析，结果显示核苷酸代谢及调控细胞能量代谢的通路存在缺陷。我们发现，此类代谢异常与损伤心肌组织中细胞呼吸的严重异常相关。在全身性Abcc6缺陷或肝脏特异性缺失Abcc6的动物中，损伤心脏的细胞呼吸功能异常表现相似，表明肝脏Abcc6表达调控损伤心脏的细胞呼吸。Abcc6缺陷状态下的心脏钙化并非继发于成骨基因表达程序的诱导，而是继发于营养不良性钙化而迅速发生，初始矿化

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。