粪菌移植缓解慢性结肠炎小鼠心脏重构与功能损伤

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE312171

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数据说明

炎症性肠病（IBD）是一种慢性炎症性疾病，具有显著的肠外表现，包括心血管功能异常。然而，慢性结肠炎是否以及如何损害心脏功能仍不清楚。我们利用两种小鼠模型——DSS处理小鼠和Il10-/-小鼠——研究了慢性结肠炎对心脏功能和转录组的影响。采用超声心动图评估心脏功能，并通过RNA测序、RT-qPCR和western blot进行分子特征分析。两种模型均表现出显著的心脏损伤，包括射血分数和缩短分数降低，以及胶原沉积增加、炎症和肌原纤维重组。分子分析显示纤维化标志物上调及β-catenin再激活，表明存在促纤维化的心脏环境。RNA测序揭示了两种模型中共有的类花生酸相关和炎症基因（Cyp2e1、Map3k6、Pck1、Cfd）上调，以及模型特异性的cAMP和cGMP信号通路、花生四烯酸和亚油酸代谢及免疫细胞反应通路的改变。

DSS结肠炎导致232个心脏基因的差异调控，而Il10-/-结肠炎则产生105个失调基因。重要的是，治疗性粪菌移植（FMT）在两种模型中均恢复了心脏功能，其特征为纤维化标志物减少和促炎基因下调，同时也减轻了肠道炎症。值得注意的是，Il10-/-小鼠在FMT后心脏恢复相对较少，突显了IL-10的心脏保护和抗炎作用。我们的研究结果提供了慢性结肠炎损害心脏功能的直接证据，阐明了结肠炎诱导的心脏重塑的新见解，并提示FMT通过减轻全身性炎症和纠正肠道菌群失调来缓解心脏功能障碍。进一步评估肠-心相互作用和基于微生物组的治疗

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。