心肌细胞TGFbeta1/2/3缺失对成纤维细胞编程的影响

该数据集来自NCBI GEO,研究心肌细胞中TGFbeta1/2/3基因缺失对心脏成纤维细胞转录编程的影响。可用于分析三重敲除心脏中成纤维细胞的转录变化,探索TGFbeta配体在心脏发育和损伤中的调控作用(来源 NCBI)

geo
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基因组分类GPL1311210090
GSE298104: Effects of TGFbeta1/2/3 deletion in cardiomyocytes on fibroblast programming

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

心肌细胞TGFbeta1/2/3缺失对成纤维细胞编程的影响

Effects of TGFbeta1/2/3 deletion in cardiomyocytes on fibroblast programming

该数据集来自NCBI GEO,研究心肌细胞中TGFbeta1/2/3基因缺失对心脏成纤维细胞转录编程的影响。数据包含1个文件(GSE298104_series_matrix.txt.gz),基于高通量测序表达谱,物种为小鼠(10090),平台为GPL13112。可用于分析三重敲除心脏中成纤维细胞的转录变化,探索TGFbeta配体在心脏发育和损伤中的调控作用(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):转化生长因子β(TGFβ)是一种分泌型生长因子,在发育和损伤过程中影响成纤维细胞分化和合成ECM及基质细胞蛋白。我们观察到,在发育早期从心肌细胞中删除Tgfb1、Tgfb2、Tgfb3基因(TGFβ配体)会导致6周龄时心脏功能障碍,并伴有成纤维细胞活性改变和ECM含量改变。本项目旨在阐明心肌细胞中缺乏TGFbeta1/2/3表达的三重敲除(TKO)心脏中,心脏成纤维细胞在转录水平上的变化。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL13112、10090。本站分类:循环系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298104

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 10 202,引用时请注意版本时效。

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    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

转化生长因子β(TGFβ)是一种分泌型生长因子,在发育和损伤过程中影响成纤维细胞分化和合成细胞外基质(ECM)及基质细胞蛋白。我们观察到,在发育早期从心肌细胞中删除Tgfb1、Tgfb2、Tgfb3基因(TGFβ配体)会导致6周龄时出现心脏功能障碍,并伴有成纤维细胞活性改变和ECM含量改变。本项目旨在阐明在心肌细胞中缺乏TGFbeta1/2/3表达的三重敲除(TKO)心脏中,心脏成纤维细胞在转录水平上的变化。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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