支气管肺发育不良伴肺动脉高压与Semaphorin信号缺失及FOXF1表达功能下降相关

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE275938

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数据说明

早产儿肺损伤会导致终生的结构和功能性呼吸缺陷，并存在支气管肺发育不良（BPD）的风险。在最严重的形式中，BPD伴有肺动脉高压（PH）。虽然BPD中肺泡生成和血管生成受损已被充分描述，但驱动这些表型的分子机制以及在人类中与进展性BPD和BPD+PH相关的细胞动力学尚未得到充分描述。我们对处于BPD早期阶段、BPD+PH的早产儿以及足月儿的肺进行了单细胞RNA测序。内皮分析揭示了一种异常的毛细血管细胞状态，主要出现在BPD+PH中，以ANKRD1表达为标志，并具有此前在已分析的人类肺部疾病中未曾描述过的转录组特征，这一发现在扩展的人类婴儿肺组织样本库中得到了验证。预测性信号分析发现，在患有BPD和BPD+PH的人类新生儿肺样本的肺泡实质中，semaphorin引导信号通路存在缺陷，促血管生成转录因子FOXF1的表达降低。

我们在小鼠BPD模型中观察到了信号素信号传导减弱的类似趋势，并在ACDMPV单核测序数据分析中也发现了相同趋势。这些在BPD+PH和ACDMPV中共同存在的信号素信号传导转录缺陷，提示BPD与ACDMPV的发育表型之间存在机制性联系，为进一步探索信号素在正常肺泡发育中的作用奠定了基础。此外，这些数据填补了目前可用的正常与疾病肺全生命周期转录组分析中的关键空白，可作为早期人类肺发育与损伤的可检索图谱。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。