心肌梗死血小板转录组数据集
源站描述显示,研究比较了急性期 MI 患者(n=40)与对照(n=38)的血小板转录本,发现肌动蛋白细胞骨架、Rho 家族 GTPase 信号、线粒体功能障碍和炎症信号相关转录本富集且随时间变化不显著;还鉴定出 79 个 MI 后长期改变的基因,并在独立心血管疾病验证队列(n=135)中与未来心血管

基本信息
资源简介
心肌梗死血小板转录组数据集
The Myocardial Infarction Platelet Transcriptome
该数据集来自 NCBI GEO,标题为 The Myocardial Infarction Platelet Transcriptome,聚焦心肌梗死患者血小板的转录组特征。源站描述显示,研究比较了急性期 MI 患者(n=40)与对照(n=38)的血小板转录本,发现肌动蛋白细胞骨架、Rho 家族 GTPase 信号、线粒体功能障碍和炎症信号相关转录本富集且随时间变化不显著;还鉴定出 79 个 MI 后长期改变的基因,并在独立心血管疾病验证队列(n=135)中与未来心血管事件相关。数据可用于探索 MI 亚型与血小板转录组特征的关系(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 12 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):尽管大量数据表明血小板在心肌梗死(MI)中起关键作用,但很少有研究对急性或慢性环境下的 MI 血小板转录组进行表征。MI 亚型与血小板转录组特征之间的关联尚未被探索。我们报告,在急性期,与肌动蛋白细胞骨架和 Rho 家族 GTPase 信号、线粒体功能障碍以及炎症信号相关的转录本在 MI 患者血小板中富集(n=40 MI,n=38 对照),并且不随时间显著变化。我们鉴定了 79 个 MI 后长期改变的血小板基因,这些基因在独立的心血管疾病验证队列(n=135)中也与未来心血管事件相关。与冠状动脉非阻塞性心肌梗死(MINOCA)患者相比,因阻塞性冠状动脉导致 MI 的患者的血小板
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:循环系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272178
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 30 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE272178
标准获取流程:
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- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
尽管有大量数据表明血小板在心肌梗死(MI)中发挥关键作用,但很少有研究对急性期或慢性期MI-血小板转录组进行特征描述。MI亚型与血小板转录组特征之间的关联尚未被探索。我们报告,在急性期,MI患者血小板中与肌动蛋白细胞骨架和Rho家族GTP酶信号传导、线粒体功能障碍及炎症信号传导相关的转录本富集(MI组n=40,对照组n=38),且随时间无显著变化。我们在独立的心血管疾病验证队列(n=135)中鉴定出79个MI后长期改变的血小板基因,这些基因也与未来心血管事件相关。与冠状动脉非阻塞性心肌梗死(MINOCA)患者相比,由阻塞性冠状动脉疾病所致MI(MI-CAD)患者的血小板中富集了中性粒细胞活化和由TNFα信号增强驱动的促炎信号通路。
层次聚类识别出三个MI转录组亚组,各具独特通路及MI相关特征,其中包括一个MI-CAD组和一个以MINOCA为主的组。我们的数据表明,MI患者的血小板在急性和慢性阶段均与未发生MI的患者表型不同,并揭示了一种具有独特临床特征的转录组特征。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




