SARS-CoV-2变异株在体外和体内对心肌细胞的差异性感染与损伤

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE250333

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

已知SARS-CoV-2变异株在呼吸道上皮细胞中表现出不同的嗜性和致病性，但其对心肌细胞（CMs）的影响尚不清楚。利用人诱导多能干细胞来源的心肌细胞（hiPSC-CMs）研究了SARS-CoV-2变异株引起的心脏感染和损伤。不同变异株在心脏中表现出不同的嗜性、病毒进入机制和病理特征。与其他受试变异株相比，Omicron BA.2在体外和体内均能有效感染心肌细胞，诱导最严重的表型，并表现出提示心脏功能障碍加重的转录组变化。生物信息学分析鉴定出预测可调控Omicron BA.2诱导的独特转录组的转录因子。Omicron BA.2感染性增强归因于其能够不依赖TMPRSS2进行感染，而心肌细胞中缺乏TMPRSS2。本研究揭示了不同SARS-CoV-2变异株感染和损伤心肌细胞方式的先前未知差异。通常被认为温和的Omicron BA.2能够在体外和体内诱导严重的心肌细胞损伤。

我们的研究强调，需要进一步调查以明确不同SARS-CoV-2变异株引起心脏并发症的发病机制。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。