Agrin、BRP44与胰岛素联合促进人心肌细胞增殖数据集

研究聚焦人房性心肌细胞从新生儿到成年阶段的增殖转变,利用先天性心脏病室间隔缺损患儿手术获取的人心房标本提取脱细胞样本,用于细胞培养与蛋白质组分析,并验证Agrin、BRP44和胰岛素等蛋白

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基因组分类GPL246769606
GSE240986: The combination of agrin, BRP44, and insulin (ABI) promote human CM proliferation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

Agrin、BRP44与胰岛素联合促进人心肌细胞增殖数据集

The combination of agrin, BRP44, and insulin (ABI) promote human CM proliferation

该数据集来自NCBI,包含1个文件GSE240986_series_matrix.txt.gz,主题为高通量测序表达谱,物种为人类(9606),平台为GPL24676。研究聚焦人房性心肌细胞从新生儿到成年阶段的增殖转变,利用先天性心脏病室间隔缺损患儿手术获取的人心房标本提取脱细胞样本,用于细胞培养与蛋白质组分析,并验证Agrin、BRP44和胰岛素等蛋白。数据可用于分析人心肌细胞增殖相关表达特征,辅助探索缩小人与啮齿类动物心脏再生转化差距的研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Aug 16 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):人心肌细胞(CMs)在许多方面与啮齿类动物不同,在啮齿类动物中有效改善心脏性能的方法在人类中未能成功,这表明人类与啮齿类动物在心脏再生方面存在转化差距。CM增殖在新生儿期和成年期之间的转变在人类和啮齿类动物中均已明确。本研究旨在分析人房性CM增殖转变,以缩小人类与啮齿类动物在心脏再生方面的转化差距。首先,我们从常规先天性心脏手术中收集的诊断为室间隔缺损(VSD)的儿童的人心房标本中提取脱细胞样本(DS)。随后,DS用于细胞培养和蛋白质组分析。在蛋白质组分析中鉴定出的蛋白质(如Agrin、BRP44和胰岛素)得到进一步验证。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:循环系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240986

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE240986

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人类心肌细胞(CMs)在许多方面与啮齿动物不同,而在啮齿动物中有效改善心脏功能的方法在人类中未能成功,这表明人类与啮齿动物在心脏再生方面存在转化差距。新生儿期与成年期之间的CM增殖转换在人类和啮齿动物中均已明确。本研究旨在分析人类心房CM的增殖转换,以缩小人类与啮齿动物在心脏再生方面的转化差距。首先,我们从常规先天性心脏病手术中收集的室间隔缺损(VSD)患儿心房标本中提取脱细胞样本(DS)。随后将DS用于细胞培养和蛋白质组学分析。通过测试其促进CM增殖的能力,进一步验证了蛋白质组学分析中鉴定出的蛋白质(如Agrin、BRP44和胰岛素)。结果显示,agrin、BRP44和胰岛素(ABI)的组合增强了agrin的效果。为进一步确认ABI对人CM增殖的作用,我们对ABI处理的HiPSC-CMs进行了RNA-seq。

结果表明,ABI诱导了细胞周期相关基因的大量富集,这凸显了激素与抗氧化/代谢在人CM增殖中的协同作用。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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