循环外泌体circRNA作为慢性冠脉综合征诊断生物标志物

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE237983

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数据说明

背景：已有报道表明环状RNA（circRNA）参与心血管疾病（CVD）的发病机制，然而，外泌体（exos）携带的circRNA能否作为慢性冠脉综合征（CCS）的生物标志物尚不清楚。本研究旨在探讨CCS患者血浆中外泌体circRNA的表达模式，并筛选可作为CCS诊断生物标志物的外泌体circRNA。方法：对15例CCS患者和15例非心源性胸痛患者（NCCP，对照组）（测序队列）的血浆外泌体RNA进行高通量测序，以筛选差异表达的circRNA。在小样本队列（推导队列）和大样本队列（验证队列）中，通过实时聚合酶链反应（RT-PCR）进一步验证筛选出的差异表达外泌体circRNA。进行受试者工作特征（ROC）曲线分析，以评估外泌体circRNA对CCS患者的诊断价值。

结果：通过对15例CCS患者和15例NCCP患者血浆外泌体中circRNA进行高通量测序，采用|log2(Fold change)|>1且q值<0.001的标准，筛选出CCS患者血浆外泌体中276个差异表达的circRNA，其中103个上调，173个下调。在103个上调的circRNA中，选取了5个在CCS患者血浆外泌体中表达水平高且显著升高的circRNA进行验证。两次RT-PCR验证表明，exo-hsa_circ_0075269和exo-hsa_circ_0000284在CCS患者中显著上调（P<0.001）。通过ROC曲线分析，循环exo-hsa_circ_0075269和exo-hsa_circ_0000284诊断CCS的曲线下面积（AUC）值分别为0.761（P<0.001，95%CI=0.669，0.852）和0.623（P=0.015，95%CI=0.522，0.724）。此外，hsa_circ_0075269联合hsa_circ_0000284诊断CCS的AUC为0.741（P<0.001，95%CI=0.667，0.850）。结论：表达

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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