ANGPTL3缺陷HepG2细胞的转录组谱
研究通过CRISPR-Cas9技术敲除HepG2细胞的ANGPTL3基因,利用高通量测序分析完全遗传缺陷对肝细胞转录组的影响

基本信息
资源简介
ANGPTL3缺陷HepG2细胞的转录组谱
Transcriptomic profile of ANGPTL3-deficient HepG2 cells
该数据集为ANGPTL3缺陷HepG2细胞的转录组表达谱数据,来源于NCBI GEO,包含1个文件(GSE232045_series_matrix.txt.gz)。研究通过CRISPR-Cas9技术敲除HepG2细胞的ANGPTL3基因,利用高通量测序分析完全遗传缺陷对肝细胞转录组的影响。数据可用于探索ANGPTL3缺失后的基因表达变化,为理解其降低LDL胆固醇的机制及心血管疾病治疗研究提供基础(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 09 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):心血管疾病是全球主要死因,抑制肝脏分泌蛋白ANGPTL3已成为降低低密度脂蛋白胆固醇(LDL)的有效治疗方法,而LDL是冠状动脉疾病(CAD)的主要危险因素。本研究利用CRISPR-Cas9技术敲除ANGPTL3基因座的HepG2细胞培养模型,检测ANGPTL3完全遗传缺陷对肝细胞转录组的影响。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:循环系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE232045
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 15 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE232045
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
心血管疾病是全球主要的死亡原因,而抑制肝脏分泌的蛋白ANGPTL3已成为降低低密度脂蛋白胆固醇(LDL)的有效治疗方法,LDL是冠状动脉疾病(CAD)的主要风险因素。在本研究中,我们利用CRISPR-Cas9技术“敲除”(KO)ANGPTL3基因座的HepG2细胞培养模型,探讨ANGPTL3完全遗传缺陷对肝细胞转录组的影响。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




