GSE212003：并行使用人类干细胞肺和心脏模型为SARS-CoV-2治疗提供见解

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE212003

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

严重急性呼吸综合征冠状病毒2型（SARS-CoV-2）主要感染呼吸道，但在重型2019冠状病毒病（COVID-19）中可出现肺部及心脏并发症。为阐明肺和心脏中的分子机制，我们在感染SARS-CoV-2的人干细胞来源的肺泡II型（AT2）上皮细胞和心脏培养物中进行了配对实验。通过CRISPR-Cas9介导的ACE2敲除，我们证明血管紧张素转换酶2（ACE2）对两种细胞类型的SARS-CoV-2感染均必不可少，但肺细胞中的进一步加工需要TMPRSS2，而心脏细胞则需要内体途径。宿主反应存在显著差异；转录组谱分析和磷酸化蛋白质组学反应强烈依赖于细胞类型。我们在肺AT2细胞和心脏细胞中鉴定出几种具有不同抗病毒和毒性特征谱的抗病毒化合物，凸显了使用多种相关细胞类型评估抗病毒药物的重要性。我们的数据为合理联合用药（Q2）以有效治疗一种影响多器官系统的病毒提供了新见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。