可变剪接lncRNA异质性表达介导血管平滑肌细胞可塑性

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE211144

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

9p21位点多态性与冠状动脉疾病的相关性最强，但作为一个非编码位点，其与疾病的关联机制仍不明确。在9p21区域发现的lncRNA ANRIL可能通过调控血管平滑肌细胞（VSMC）表型来参与疾病风险。我们观察到，来自风险等位基因纯合患者、同基因敲除型或非风险单倍型的诱导多能干细胞来源VSMC之间存在显著差异。风险单倍型细胞的亚群表现出不同的形态、增殖、收缩和黏附特性。按黏附能力分选后，风险VSMC可分为合成型与收缩型亚群，即弱黏附型和强黏附型。由单倍型和黏附共同调控的差异表达基因中，超过90%与Rho GTPases相关，即与收缩性相关。弱黏附亚群表达更多ANRIL短异构体，而在敲除细胞中过表达ANRIL可抑制黏附、收缩性及αSMA表达。这些数据首次提示，lncRNA外显率差异可能驱动混合的功能性结局，从而干扰病理学判断。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。