GSE206197:POLR1A杂合变异导致多样人类表型

研究聚焦POLR1A杂合致病性变异导致的多种人类表型,包括颅面畸形、发育迟缓、婴儿痉挛和心脏结构缺陷,并利用小鼠体内与体外模型探索致病机制

geo
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基因组分类GPL2424710090
GSE206197: Heterozygous variants in POLR1A cause diverse human phenotypes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-26

资源简介

GSE206197:POLR1A杂合变异导致多样人类表型

Heterozygous variants in POLR1A cause diverse human phenotypes

该数据集来自NCBI GEO,标题为“Heterozygous variants in POLR1A cause diverse human phenotypes”,包含1个文件GSE206197_series_matrix.txt.gz。研究聚焦POLR1A杂合致病性变异导致的多种人类表型,包括颅面畸形、发育迟缓、婴儿痉挛和心脏结构缺陷,并利用小鼠体内与体外模型探索致病机制。数据可用于分析POLR1A变异相关的基因表达特征,支持疾病分类与机制研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Jun 15 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):2015年,POLR1A的杂合致病性变异被确定为辛辛那提型肢面骨发育不全的病因。在最初3名受累个体中观察到的主要表型是类似Treacher Collins综合征的颅面畸形。我们随后又发现了17名携带12个独特(11个新发)POLR1A杂合变异的个体,并观察到许多其他表型,包括发育迟缓、婴儿痉挛和结构性心脏缺陷。为了理解这种多效性的发病机制,我们结合体内(小鼠)和体外模型创建了POLR1A的等位基因系列。我们描述了Polr1a在小鼠胚胎发生过程中不同的时空需求,并确定了Polr1a对于迁移前和迁移中的神经嵴细胞、前脑前体细胞以及第二心脏场存活的需求。我们使用

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:循环系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206197

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 20 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE206197

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

2015年,POLR1A基因的杂合致病性变异被确定为辛辛那提型肢面骨发育不全的病因。在最初3名受累个体中观察到的主要表型为类似Treacher Collins综合征的颅面畸形。我们随后又发现了17名携带POLR1A基因12种独特(其中11种为新发现)杂合变异的个体,并观察到许多其他表型,包括发育迟缓、婴儿痉挛和结构性心脏缺陷。为理解这种多效性的发病机制,我们利用体内(小鼠)和体外模型的组合,构建了POLR1A的等位基因系列。我们描述了Polr1a在小鼠胚胎发育过程中独特的时空需求,并确定了Polr1a对于迁移前和迁移中的神经嵴细胞、前脑前体细胞以及第二心脏 field 存活的需求。我们使用CRISPR/Cas9在小鼠中重现了两个人类等位基因,证明其中一个具有致病性,而另一个可能为良性。

我们的工作极大地扩展了人类POLR1A相关疾病的表型,提供了POLR1A杂合变异不完全外显和表达变异的新证据,并展示了表征和确定变异致病性的多方面方法。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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