GSE205302：NONO优先结合外显子-内含子边界并调控大鼠心脏成纤维细胞可变剪接[RNA-seq]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE205302

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

心肌纤维化发生于多种心脏疾病中。作为心脏活化肌成纤维细胞蛋白的标志物之一，NONO可能参与该过程，但其潜在机制尚未被探索。NONO被认为在心脏纤维化中发挥调控全局转录组谱的作用，因此在大鼠心肌细胞中被沉默。采用RNA-seq及改进的RNA免疫沉淀测序（iRIP-seq）分析NONO所致的转录组失调，以及对照组和siNONO组中NONO结合的RNA。应用定量PCR和western blotting检测大鼠心肌细胞中NONO调控的mRNA及蛋白表达水平。RNA-seq和iRIP-seq成功完成，并表征了NONO结合的RNA。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。