GSE298179:miR-29与急性A型主动脉夹层患者术后神经系统并发症的关联

研究围绕急性A型主动脉夹层(AAD)术后神经系统并发症(PONC)的早期诊断生物标志物展开,采用深低温停循环(DHCA)大鼠模型进行海马组织miRNA测序以筛选差异表达基因并分析相关生物学过程与通路,同时纳入95例AAD患者进行临床评估、神经心理测试及血清miR-29水平检测

geo
浏览 11
基因组分类GPL3514410114
GSE298179: Association of miR-29 with postoperative neurological complications in acute type A aortic dissection patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

GSE298179:miR-29与急性A型主动脉夹层患者术后神经系统并发症的关联

Association of miR-29 with postoperative neurological complications in acute type A aortic dissection patients

该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE298179_series_matrix.txt.gz),主题为非编码RNA高通量测序,平台为GPL35144。研究围绕急性A型主动脉夹层(AAD)术后神经系统并发症(PONC)的早期诊断生物标志物展开,采用深低温停循环(DHCA)大鼠模型进行海马组织miRNA测序以筛选差异表达基因并分析相关生物学过程与通路,同时纳入95例AAD患者进行临床评估、神经心理测试及血清miR-29水平检测。数据可用于探索miR-29与PONC的关联及候选生物标志物分析(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:May 27 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):目的。术后神经系统并发症(PONC)与显著的发病率和死亡率相关,是急性A型主动脉夹层(AAD)手术修复后常见的临床挑战。本研究旨在识别用于PONC早期诊断的新型生物标志物,以促进及时的临床干预。方法。我们建立了深低温停循环(DHCA)大鼠模型,从大鼠海马(DHCA组和对照组)提取总RNA,进行miRNA测序,筛选两组之间的差异表达基因(DEGs),并分析其相关的生物学过程(BP)和通路。本研究纳入了一个由95例确诊为AAD的患者组成的队列。系统进行了全面的临床评估和标准化的神经心理测试组合。血清miR-29水平通过

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL35144、10114。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298179

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 13 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298179

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的。术后神经并发症(PONC)与显著的发病率和死亡率相关,是急性A型主动脉夹层(AAD)手术修复后常见的临床挑战。本研究旨在识别用于PONC早期诊断的新型生物标志物,以促进及时的临床干预。方法。我们建立了深低温停循环(DHCA)大鼠模型,从大鼠海马(DHCA组和对照组)提取总RNA,进行miRNA测序,筛选两组之间的差异表达基因(DEGs),并分析其相关的生物学过程(BP)和通路。本研究纳入了95例诊断为AAD的患者。系统进行了全面的临床评估和标准化神经心理测试组合。通过逆转录定量实时聚合酶链反应定量血清miR-29水平。结果。

大鼠海马在深低温停循环/体外循环(DHCA/CPB)下的转录组学分析鉴定出37个差异表达miRNA(|log2FC|≥1.3,P<0.05),其中miR-29a-5p和miR-29b-3p的表达失调最为显著。功能富集分析提示MAPK信号通路和连接通路参与血脑屏障调控。在95例主动脉夹层患者的临床队列中,PONC组表现出体外循环时间延长(164.00(137.00,193.00)vs. 140.00(120.25,161.00),P=0.012)、炎症生物标志物升高(术前白细胞介素-6:106.60 vs. 47.00,P<0.001)以及miR-29表达谱改变。多因素分析证实术前miR-29b-3p(OR=2.53,95%CI 1.17-5.47)和术后miR-29a-5p(OR=0.21,95%CI 0.05-0.96)为PONC的独立预测因素。列线图显示出良好的区分度(AUC=0.867,95%CI 0.771-0.963)和临床实用性(净获益=0.23),30天生存分析揭示miR-29b-3p相关死亡

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案