GSE298179:miR-29与急性A型主动脉夹层患者术后神经系统并发症的关联
研究围绕急性A型主动脉夹层(AAD)术后神经系统并发症(PONC)的早期诊断生物标志物展开,采用深低温停循环(DHCA)大鼠模型进行海马组织miRNA测序以筛选差异表达基因并分析相关生物学过程与通路,同时纳入95例AAD患者进行临床评估、神经心理测试及血清miR-29水平检测

基本信息
资源简介
GSE298179:miR-29与急性A型主动脉夹层患者术后神经系统并发症的关联
Association of miR-29 with postoperative neurological complications in acute type A aortic dissection patients
该数据集来自NCBI GEO,包含1个文件(GSE298179_series_matrix.txt.gz),主题为非编码RNA高通量测序,平台为GPL35144。研究围绕急性A型主动脉夹层(AAD)术后神经系统并发症(PONC)的早期诊断生物标志物展开,采用深低温停循环(DHCA)大鼠模型进行海马组织miRNA测序以筛选差异表达基因并分析相关生物学过程与通路,同时纳入95例AAD患者进行临床评估、神经心理测试及血清miR-29水平检测。数据可用于探索miR-29与PONC的关联及候选生物标志物分析(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:May 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目的。术后神经系统并发症(PONC)与显著的发病率和死亡率相关,是急性A型主动脉夹层(AAD)手术修复后常见的临床挑战。本研究旨在识别用于PONC早期诊断的新型生物标志物,以促进及时的临床干预。方法。我们建立了深低温停循环(DHCA)大鼠模型,从大鼠海马(DHCA组和对照组)提取总RNA,进行miRNA测序,筛选两组之间的差异表达基因(DEGs),并分析其相关的生物学过程(BP)和通路。本研究纳入了一个由95例确诊为AAD的患者组成的队列。系统进行了全面的临床评估和标准化的神经心理测试组合。血清miR-29水平通过
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL35144、10114。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE298179
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 13 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
目的。术后神经并发症(PONC)与显著的发病率和死亡率相关,是急性A型主动脉夹层(AAD)手术修复后常见的临床挑战。本研究旨在识别用于PONC早期诊断的新型生物标志物,以促进及时的临床干预。方法。我们建立了深低温停循环(DHCA)大鼠模型,从大鼠海马(DHCA组和对照组)提取总RNA,进行miRNA测序,筛选两组之间的差异表达基因(DEGs),并分析其相关的生物学过程(BP)和通路。本研究纳入了95例诊断为AAD的患者。系统进行了全面的临床评估和标准化神经心理测试组合。通过逆转录定量实时聚合酶链反应定量血清miR-29水平。结果。
大鼠海马在深低温停循环/体外循环(DHCA/CPB)下的转录组学分析鉴定出37个差异表达miRNA(|log2FC|≥1.3,P<0.05),其中miR-29a-5p和miR-29b-3p的表达失调最为显著。功能富集分析提示MAPK信号通路和连接通路参与血脑屏障调控。在95例主动脉夹层患者的临床队列中,PONC组表现出体外循环时间延长(164.00(137.00,193.00)vs. 140.00(120.25,161.00),P=0.012)、炎症生物标志物升高(术前白细胞介素-6:106.60 vs. 47.00,P<0.001)以及miR-29表达谱改变。多因素分析证实术前miR-29b-3p(OR=2.53,95%CI 1.17-5.47)和术后miR-29a-5p(OR=0.21,95%CI 0.05-0.96)为PONC的独立预测因素。列线图显示出良好的区分度(AUC=0.867,95%CI 0.771-0.963)和临床实用性(净获益=0.23),30天生存分析揭示miR-29b-3p相关死亡
数据加载示例(图像类)
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import glob, os
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print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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