人胰岛ANRIL circRNA亚型高通量分析数据集

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE192541

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

INK4基因座中的反义非编码RNA（ANRIL）起源于CDKN2A/B（INK4-ARF）基因座，已被确定为与心脏代谢疾病（包括冠状动脉疾病（CAD）和2型糖尿病（T2D））相关的遗传变异热点。我们最近发现，在携带某些T2D风险SNP的供者中，人胰岛中ANRIL的丰度增加，并且位于ANRIL外显子2内的一个T2D风险SNP导致β细胞增殖指数降低，这表明ANRIL通过影响胰岛素分泌能力在调节T2D致病性中发挥作用。最近在其他细胞类型中的研究发现，ANRIL的线性与环状形式之间的平衡与心血管疾病表型的调控有关。关于糖尿病相关细胞类型中环状ANRIL的表达及其丰度如何影响T2D风险，目前了解较少。在此，我们采用高通量和发散引物测序技术对人胰岛细胞中的环状RNA进行测序，以定量和表征ANRIL的环状异构体。

我们鉴定出几种环状ANRIL异构体，其丰度高于线性ANRIL，且其表达在数十个个体间具有相关性。反向剪接并非在ANRIL所有剪接位点以相同概率发生。相反，某些特定剪接位点被发现更倾向于参与反向剪接，并且这些位点对已知促进反向剪接的序列特征有微弱富集。最后，我们发现，与保护等位基因携带者相比，ANRIL第2外显子rs564398位点T2D风险等位基因携带者的胰岛中，环状ANRIL相对于线性ANRIL的比值更高，并且较高的环状:线性ANRIL比值与β细胞增殖指数降低相关。总之，我们的研究提示线性和环状ANRIL种类共同参与T2D表型，并为未来研究理解其分子机制打开了大门。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。