冠状动脉疾病相关变异对血管平滑肌细胞的影响
该数据集来自 NCBI,标题为冠状动脉疾病相关变异对血管平滑肌细胞的影响,包含对大规模血管平滑肌细胞库(n = 1,499)进行的 RNA 测序分析

基本信息
资源简介
冠状动脉疾病相关变异对血管平滑肌细胞的影响
GSE189300 数据集来自 NCBI,主题为冠状动脉疾病相关变异对血管平滑肌细胞的影响。该数据集围绕大规模血管平滑肌细胞库开展 RNA 测序分析,样本规模为 n = 1,499,旨在从表达谱层面观察冠状动脉疾病相关变异在血管平滑肌细胞中的作用。数据集以高通量测序表达谱分析为核心,附带一个可供下载的系列矩阵文件,适合关注循环系统疾病、冠状动脉疾病遗传变异与血管平滑肌细胞功能关系的研究者参考使用。整体而言,该数据集提供了一个较大规模的血管平滑肌细胞转录组资源,其标题、来源与样本规模信息明确,但更细的样本构成、实验条件与统计结果需以源站记录为准。
【数据集背景】
冠状动脉疾病是循环系统疾病中的重要类型,其遗传变异如何影响血管壁细胞的功能,是理解疾病机制的一个研究方向。血管平滑肌细胞是血管壁的主要细胞成分之一,其表达状态与血管功能密切相关。该数据集以“冠状动脉疾病相关变异对血管平滑肌细胞的影响”为主题,通过对大规模血管平滑肌细胞库进行 RNA 测序分析,为研究相关变异在血管平滑肌细胞中的表达效应提供数据基础。数据集在站内分类中归入循环系统疾病 / 其他,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,作者为 Charles,U,Solomon,发布时间为 Nov 22 202。
【数据内容】
该数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE189300_series_matrix.txt.gz,属于 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。主题标签包括 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL24676 与 9606,分别指向高通量测序表达谱分析、所用平台以及人类物种信息。源站描述指出,研究对大规模血管平滑肌细胞库(n = 1,499)进行了 RNA 测序分析。除上述信息外,矩阵文件内部的具体字段、样本分组、基因注释与表达量数值等细节,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI,源站标题与数据集英文名一致,均为 Effects of coronary artery disease-associated variants on vascular smooth muscle cells。源站描述说明研究对 n = 1,499 的血管平滑肌细胞库开展 RNA 测序分析。数据集作者为 Charles,U,Solomon,发布时间为 Nov 22 202。关于样本的具体来源组织、供体信息、伦理审批与测序实验流程等,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与冠状动脉疾病遗传变异、血管平滑肌细胞转录组及高通量表达谱分析相关的研究场景,例如观察大规模血管平滑肌细胞库中的基因表达模式,或围绕冠状动脉疾病相关变异开展表达层面的探索性分析。由于主题标签涉及高通量测序表达谱,也可用于方法学比较与表达谱数据处理的练习。具体分析目标是否可行,需结合矩阵文件的实际内容判断;源站未提供针对特定分析场景的说明。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE189300_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段含义或编码不一致导致后续分析偏差。由于该数据集仅提供一个系列矩阵文件,使用时应以该文件为主要数据入口,并结合源站记录确认平台与物种信息。更详细的读取参数与分析流程,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集样本规模较大(n = 1,499),主题与平台信息明确,文件数量为 1,结构相对简单。但源站未提供矩阵文件的具体字段说明、样本分组细节、数据质控指标与缺失值情况,因此在使用前需自行核对数据内容。此外,数据集发布时间为 Nov 22 202,作者信息为 Charles,U,Solomon,其他版本更新与勘误信息源站未提供。对于依赖详细临床注释或实验条件的研究,需谨慎评估该数据集的适用性。
【引用与许可】
该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,引用时应注明数据集英文名 GSE189300 及其源站标题,并可参考作者 Charles,U,Solomon 与发布时间 Nov 22 202。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供,使用前应查阅源站相关说明并遵循其要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE189300
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
We undertook RNA-sequencing analysis on a large bank (n = 1,499) of vascular smooth muscle cells (VSMCs).
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




