人内皮细胞中Phactr1过表达的转录组分析

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE186761

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Phactr-1是一种肌动蛋白和蛋白磷酸酶1（PP1）结合蛋白，据报道在脑中高表达，并控制PP1活性和F-肌动蛋白重塑。全基因组关联研究（GWAS）表明Phactr-1基因座（6p24）是五种血管疾病的风险因素，包括冠状动脉疾病、偏头痛、颈动脉夹层、纤维肌性发育不良和高血压，其作用机制尚未完全明了。为描述Phactr1如何调节内皮细胞功能，我们对感染Phactr1腺病毒的人脐静脉内皮细胞（HUVECs）进行了转录组分析。我们记录到Phactr1过表达触发内皮功能障碍的多个方面，从而为Phactr1介导的疾病相关血管功能提供了机制基础。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。