心外膜与皮下脂肪组织表达谱

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE18612

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

心外膜脂肪组织（EAT）是一种与冠状动脉血管紧密相邻的内脏脂肪组织，其增多与冠状动脉疾病（CAD）相关。我们的目标是鉴定能够表征EAT并可能参与CAD发病机制的候选分子。我们采用微阵列结合生物信息学序列分析工具（TargetP）预测分泌蛋白的方法，对取自伴或不伴CAD患者（NCAD）的配对皮下脂肪组织（SAT）和EAT活检标本进行了研究。结果在3个独立受试者组中通过RT-qPCR、蛋白质印迹、免疫组织化学和外植体分泌实验进行了验证。在编码潜在分泌蛋白的基因中，sPLA2-IIA在CAD和NCAD患者的EAT中均呈现最高过表达，位列第一。RT-qPCR证实其在EAT中表达增加（p<0.01），且CAD患者EAT中的表达高于NCAD患者（49.3 ±13 vs. 17.4 ± 9.7，p<0.01）。sPLA2-IIA蛋白水平在EAT中高于SAT。EAT外植体的sPLA2-IIA分泌水平也显著高于SAT外植体（4.37±2.7 vs 0.67± 0.28 ng.ml-1/g组织/24h，p<0.03）。

在脂肪细胞之间的基质血管组分及结缔组织被膜中，可见sPLA2-IIA在EAT中的标记，而脂肪细胞本身无免疫染色。SAT则按相同模式呈现弱标记。结论：我们首次证实CAD患者EAT中sPLA2-IIA表达增加，该磷脂酶已被证明是CAD的独立危险因素。这些发现提示EAT在CAD中可能具有病理生理学作用。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。