健康和LQT1 hiPSC-CMs中miR-365调控的单细胞RNA-seq
该数据集为GSE185688,包含健康和LQT1患者来源的hiPSC-CMs在调控miR-365后的单细胞RNA-seq表达谱数据,共1个文件

基本信息
资源简介
健康和LQT1 hiPSC-CMs中miR-365调控的单细胞RNA-seq
single cell RNA-seq in healthy and LQT1 hiPSC-CMs upon manipulation of miR-365
该数据集为GSE185688,包含健康和LQT1患者来源的hiPSC-CMs在调控miR-365后的单细胞RNA-seq表达谱数据,共1个文件。数据可用于研究miR-365对人心室动作电位复极化离子通道的调控作用,以及其在长QT综合征等心律失常中的治疗潜力,支持单细胞水平的转录组分析与差异表达研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Oct 11 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):心室动作电位(AP)异常会导致恶性心律失常和心源性猝死。在此,我们试图鉴定调控人类心脏AP的microRNA(miRNA),并探究对其操作是否能够实现对AP异常的治疗性调节。对人类心肌细胞中miRNA靶标组的定量分析鉴定出miR-365是调控复极化离子通道的主要miRNA。患者特异性诱导多能干细胞来源心肌细胞(iPSC-CMs)的AP记录显示,升高miR-365水平显著延长了来自短QT综合征(SQTS)患者的hiPSC-CMs的AP持续时间,而特异性抑制miR-365则使长QT综合征(LQTS)iPSC-CMs中病理性延长的AP正常化。在bulk和单细胞水平对人类iPSC-CMs的转录组分析证实了关键的心脏复极化
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20301、9606。本站分类:循环系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE185688
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jan 28 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
心室动作电位(AP)异常可导致恶性心律失常和心源性猝死。本研究旨在鉴定调控人类心脏动作电位的微小RNA(miRNA),并探讨通过操控这些miRNA是否可实现动作电位异常的治疗性调节。对人心脏心肌细胞miRNA靶标组的定量分析鉴定出miR-365是调控复极化离子通道的主要miRNA。患者特异性诱导多能干细胞来源心肌细胞(iPSC-CMs)的动作电位记录显示,在来源于短QT综合征(SQTS)患者的hiPSC-CMs中,升高miR-365水平可显著延长动作电位时程;而特异性抑制miR-365则可逆转长QT综合征(LQTS)iPSC-CMs中病理性延长的动作电位。在bulk和单细胞水平对人iPSC-CMs进行的转录组分析证实,关键心脏复极化通道是miR-365的直接靶标,同时该miRNA还对其他动作电位调控基因发挥功能协同性调控作用。全细胞膜片钳实验揭示了基于miR-365的复极化离子电流调控机制。
最后,在人心肌切片中进行的不应期测量证实了miR-365在成人人心肌组织中也具有延长动作电位时程的作用。我们的结果阐明了miR-365通过靶向心脏复极化的关键因子来调控人心肌动作电位时程。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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