TP53介导的克隆性造血增加新发外周动脉疾病风险

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE184420

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数据说明

背景：血液中提示意义未明的克隆性造血（CHIP）的体细胞突变，尤其是DNMT3A、TET2和JAK2基因的突变，与血液系统恶性肿瘤、冠状动脉疾病及全因死亡风险增加相关。然而，CHIP是否与外周动脉疾病（PAD）风险增加相关仍不清楚。此外，化疗常导致DNA损伤修复（DDR）基因TP53和PPM1D发生突变，而由DDR基因体细胞突变所致的CHIP是否会导致动脉粥样硬化风险增加尚不明确。我们试图检验CHIP以及由DDR基因所致的CHIP是否与新发外周动脉疾病（PAD）和动脉粥样硬化相关。方法：我们在来自UK Biobank和Mass General Brigham Biobank个体的50,122例外显子组序列中识别了CHIP，并检验了CHIP状态（N=2,851）与新发PAD及多血管床动脉粥样硬化的关联。

为模拟人类克隆性造血的情景并检验p53缺陷造血细胞的扩增是否促进动脉粥样硬化，采用竞争性骨髓移植（BMT）策略构建了携带20% Trp53-/-造血细胞的动脉粥样硬化易感Ldlr-/-嵌合小鼠（20% KO-BMT小鼠）。随后，我们在移植后12周评估了主动脉斑块负荷和斑块巨噬细胞积聚情况。结果：CHIP与偶发PAD相关（HR 1.7；P=2.2x10-5），并与多个血管床的动脉粥样硬化相关（HR 1.3；P=9.7x10-5），在DDR CHIP个体中风险增加（HR 2.0；P=0.0084）。在动脉粥样硬化易感Ldlr缺失小鼠中，p53-/- 20% KO-BMT小鼠表现出主动脉斑块尺寸增大（p=0.013）和p53-/-斑块巨噬细胞积聚（P<0.001），这是由大量p53缺陷斑块巨噬细胞所驱动。p53缺陷细胞的扩增并未影响动脉粥样硬化主动脉壁中促炎细胞因子IL-6和IL-1β的表达。结论：我们的发现强调

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。