雌二醇对祖细胞来源平滑肌细胞与内皮细胞生长及基因应答的差异效应

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE171709

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数据说明

冠状动脉疾病是女性死亡的主要原因。平滑肌细胞的异常生长和内皮损伤会导致血管增厚和血管闭塞。雌二醇通过促进内皮细胞生长和抑制平滑肌细胞生长来防止血管重塑。近期研究表明，循环（骨髓来源的）祖细胞也参与血管重塑过程。雌二醇是否部分通过抑制P-SMC生长来发挥其保护作用仍不清楚。在本研究中，祖平滑肌细胞（P-SMCs）和内皮祖细胞（P-ECs）由从人脐带血来源的单核细胞中磁性分离的CD34+祖细胞（PC）培养而来。培养P-SMC和P-EC细胞集落，并对其平滑肌细胞和内皮细胞标志物进行表征。进一步使用培养的细胞评估17β-雌二醇（E2；10nM）对其生长和基因表达的影响。简言之，将P-SMCs或P-ECs在补充有2.5%胎牛血清（无类固醇；SF）的DMEM-F12中，用或不用10 nM E2处理0、4或30小时。随后，使用RNeasy Mini Kit（QIAGEN）提取总RNA并进行基因分析。

用E2处理P-SMCs可抑制2.5% SF血清诱导的生长（DNA合成和细胞数量），而E2则促进P-ECs的细胞生长。E2在P-SMCs和P-ECs中的生长效应可被ER-α激动剂模拟，并被ER-α拮抗剂阻断。E2对P-SMC和P-EC生长的差异效应也反映在ERK1/2和Akt磷酸化以及细胞周期的正负调控因子上。基因分析显示，P-SMCs表达SMC α肌动蛋白（ACTA2），而P-ECs表达CD34、FLT1和vWF，证实了祖细胞向SMCs和ECs的分化。用E2处理30小时，在P-SMCs中调控了1791个基因，在P-ECs中调控了220个基因，其中36个为共同调控基因。火山图分析显示，用E2处理30小时可差异表达多个基因，重要的是，雌二醇显著

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。