冠状动脉疾病患者与对照外周血浆差异表达lncRNA高通量筛选
该数据集来自NCBI GEO,聚焦冠状动脉疾病(CAD)患者与对照外周血浆中差异表达lncRNA的高通量筛选。研究对三对临床CAD组与对照血浆样本进行高通量测序,利用Cuffdiff软件获取lncRNA表达谱,基于fold change和p-value鉴定差异表达lncRNA,并在大样本中通过Q-P

基本信息
资源简介
冠状动脉疾病患者与对照外周血浆差异表达lncRNA高通量筛选
High-throughput screening of differentially expressed lncRNAs in peripheral blood plasma between coronary artery disease patients and controls
该数据集来自NCBI GEO,聚焦冠状动脉疾病(CAD)患者与对照外周血浆中差异表达lncRNA的高通量筛选。研究对三对临床CAD组与对照血浆样本进行高通量测序,利用Cuffdiff软件获取lncRNA表达谱,基于fold change和p-value鉴定差异表达lncRNA,并在大样本中通过Q-PCR验证外周血浆及血单核细胞中的差异表达基因。研究发现uc003pxg.1、ENST00000565257、ENST00000568324在CAD患者外周血单核细胞中明显上调,与测序结果一致。数据可用于CAD相关lncRNA标志物的初步筛选与后续研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 06 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在发现外周血中与冠状动脉疾病(CAD)相关的未知LncRNA。本实验采用高通量测序方法检测了三对临床CAD组和对照血浆样本。使用Cuffdiff软件获取LncRNA的表达谱,基于fold change和p-value鉴定差异表达的LncRNA。在临床CAD组和对照的大样本中,通过Q-PCR验证外周血浆和血单核细胞中的差异表达基因。我们发现三个LncRNA uc003pxg.1、ENST00000565257、ENST00000568324在CAD患者外周血单核细胞中明显上调,且这些结果与测序结果一致。初步检测到了理想的LncRNA。这一发现为进一步研究奠定了基础,并提供了LncRNA的理论依据
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL20301、9606。本站分类:循环系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE171551
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 14 202,引用时请注意版本时效。
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数据说明
本研究旨在发现外周血中与冠状动脉粥样硬化性心脏病(CAD)相关的未知LncRNA。本实验采用高通量测序方法,对三对临床CAD组与对照组血浆样本进行了检测。使用Cuffdiff软件获取LncRNA表达谱,基于倍数变化和p值鉴定差异表达的LncRNA。通过Q-PCR在临床CAD组与对照组的大样本中验证外周血浆及血单核细胞中的差异表达基因。我们发现三个LncRNA uc003pxg.1、ENST00000565257、ENST00000568324在CAD患者外周血单个核细胞中明显上调,且这些结果与测序结果一致。初步检测到了理想的LncRNA。这一发现为进一步研究奠定了基础,并为LncRNA用于CAD早期临床筛查提供了理论依据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络,提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




