先天性心脏病候选基因在成人人类心房与心室组织中的表达

该数据集来自 NCBI GEO(GSE161016),利用单核 RNAseq 技术分析成人心脏右心房与室间样本中四个先天性心脏病候选基因(MACROD2、GOSR2、WNT3、MSX1)的表达情况

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基因组回归GPL246769606
GSE161016: Expression of candidate genes associated with congenital heart disease in adult human atrial and ventricular tissue

基本信息

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创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

先天性心脏病候选基因在成人人类心房与心室组织中的表达

Expression of candidate genes associated with congenital heart disease in adult human atrial and ventricular tissue

该数据集来自 NCBI GEO(GSE161016),利用单核 RNAseq 技术分析成人心脏右心房与室间样本中四个先天性心脏病候选基因(MACROD2、GOSR2、WNT3、MSX1)的表达情况。数据覆盖成人心脏多种细胞类型,包含 1 个文件(GSE161016_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱分析。该数据可用于研究上述候选基因在成人心脏不同细胞类型中的表达分布,为先天性心脏病相关基因功能研究提供表达层面的参考(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 06 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们使用单核 RNAseq 技术分析了四个候选基因(MACROD2、GOSR2、WNT3、MSX1)在成人心脏右心房和室间样本中的表达。我们发现 MACROD2 在所有成人心脏细胞类型中均有稳健表达。相比之下,在成人心脏的任何细胞中均未检测到 GOSR2 的表达。WNT3 在成纤维细胞、心外膜和心内膜细胞、平滑肌细胞和心肌细胞中呈散在表达。MSX1 的表达显示出类似的孤立表达模式,但未在平滑肌细胞和心肌细胞中发现。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24676、9606。本站分类:循环系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE161016

【使用注意】

· 源站最后修改于 Dec 30 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们采用单核RNA测序技术分析了成人心脏右心房和室间隔样本中四个候选基因(MACROD2、GOSR2、WNT3、MSX1)的表达。我们发现MACROD2在所有成人心脏细胞类型中均有稳定表达。相比之下,在成人心脏的任何细胞中均未检测到GOSR2的表达。WNT3在成纤维细胞、心外膜和心内膜细胞、平滑肌细胞及心肌细胞中呈散在表达。MSX1的表达也呈现类似的孤立表达模式,但未在平滑肌细胞和心肌细胞中发现其表达。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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