GSE158815：Trib1通过Cebpa介导调控肝细胞LDL受体调节小鼠LDL代谢

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE158815

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数据说明

Tribbles同源蛋白1（TRIB1）由TRIB1基因编码，全基因组关联研究（GWAS）已确认其可能是大量心脏代谢性状的致病因素，包括血浆脂质、肝脂肪变性、脂联素水平及冠状动脉疾病。在其最为人所知的功能中，Tribbles 1与泛素连接酶COP1蛋白相互作用，促使转录因子CCAAT/增强子结合蛋白α和β（CEBP α/β）经蛋白酶体降解。我们此前已发表研究指出，小鼠体内特异性敲除Trib1会增加从头脂肪生成、肝脂肪变性及血浆甘油三酯，这至少部分归因于肝脏Cebpa蛋白水平升高。然而，Trib1调控血浆脂质，特别是LDL-C代谢的具体机制仍不清楚。本实验旨在识别肝脏Trib1依赖Cebpa表达特异性调控LDL-C代谢可能涉及的分子相互作用。为此，我们比较了野生型小鼠、肝脏特异性敲除Trib1、Cebpa及Trib1;Cebpa小鼠肝脏中的总基因表达。

随后，将基因表达数据用于Ingenuity Pathway分析，以识别可能导致所观察到的基因表达变化的上游转录因子。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。