小鼠心肌梗死多组学图谱
该数据集为小鼠心肌梗死模型的多组学表达谱数据，包含转录组和蛋白质组信息，覆盖对照组及梗死后10分钟、1小时、6小时、24小时和72小时多个时间点
基本信息
资源简介
小鼠心肌梗死多组学图谱
GSE153494 是一个围绕小鼠心肌梗死模型开展的多组学表达谱数据集，来源为 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），标题为“Multi-omics profiling of mouse myocardial infarction”。该数据集通过结扎左前降支冠状动脉近端构建小鼠心肌梗死模型，并在对照组及梗死后 10 分钟、1 小时、6 小时、24 小时和 72 小时多个时间点采集转录组与蛋白质组信息，用于刻画梗死发生后不同阶段的分子变化。数据集归类于循环系统疾病 / 其他，包含 1 个数据文件，样例文件为 GSE153494_series_matrix.txt.gz，由 Junwei、Shen 发布，发布时间为 Jun 29 202（原文如此）。整体而言，该数据集适合用于研究心肌梗死早期至亚急性期的多组学动态特征及相关通路变化。
【数据集背景】
心肌梗死是冠状动脉疾病最严重的表现形式，属于多因素参与的病理生理过程。为在可控条件下研究其分子机制，该数据集构建了小鼠心肌梗死模型，具体方式为结扎左前降支冠状动脉近端。在此基础上，研究者对梗死后的多个时间点进行检测与分析，覆盖转录组和蛋白质组两个层面，从而为理解心肌梗死发生发展过程中的基因表达与蛋白表达变化提供数据基础。数据集所属分类为循环系统疾病 / 其他，主题涉及高通量测序表达谱分析。
【数据内容】
该数据集的核心内容是小鼠心肌梗死模型的多组学表达谱，包括转录组和蛋白质组信息。采样时间点涵盖对照组以及梗死后 10 分钟、1 小时、6 小时、24 小时和 72 小时，能够反映梗死发生后从极早期到较晚时间窗口的分子动态。源站描述指出，心肌梗死后免疫相关通路、焦亡通路和自噬通路显著升高，这些通路层面的观察是该数据集所支持的重要分析方向。数据集文件数量为 1，样例文件名为 GSE153494_series_matrix.txt.gz，属于表达谱矩阵形式的压缩文件。
【采集与来源】
数据来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），源站标题为“Multi-omics profiling of mouse myocardial infarction”。样本材料为小鼠心肌梗死模型，模型通过结扎左前降支冠状动脉近端建立。检测与分析覆盖转录组和蛋白质组，并按对照组、10 分钟、1 小时、6 小时、24 小时和 72 小时等时间点组织。数据集作者为 Junwei、Shen，发布时间为 Jun 29 202（原文如此）。主题标签涉及高通量测序表达谱分析，并标注了 GPL24247 与 10090 等信息。
【适用场景】
该数据集适用于心肌梗死相关的多组学表达谱研究，尤其是需要考察梗死后不同时间点转录组与蛋白质组变化的研究场景。由于覆盖对照及 10 分钟、1 小时、6 小时、24 小时和 72 小时多个时间点，可用于分析梗死早期与后续阶段的分子动态，也可围绕源站描述中提到的免疫相关通路、焦亡通路和自噬通路开展进一步探索。此外，该数据集可作为一种小鼠心肌梗死模型的表达谱参考，用于方法学比较、候选分子筛选或通路层面的假设生成。具体研究设计是否适配，仍需结合数据实际内容判断。
【使用方法】
使用该数据集时，可先下载数据文件 GSE153494_series_matrix.txt.gz，并按文件格式以 GZIP 压缩包方式读取。建议先在小样本上核对字段与编码，确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件，读取后应重点确认样本分组与时间点信息是否与对照、10 分钟、1 小时、6 小时、24 小时和 72 小时的设定相对应，再开展转录组与蛋白质组层面的分析。涉及通路分析时，可结合源站描述中提及的免疫相关通路、焦亡通路和自噬通路进行解读。
【质量与限制】
该数据集文件数量为 1，样例文件为 GSE153494_series_matrix.txt.gz，使用前需核对文件内容与编码。源站描述仅概括性地指出心肌梗死后免疫相关通路、焦亡通路和自噬通路显著升高，未提供具体的样本量、重复数、统计方法或质控指标，相关细节源站未提供。数据仅针对小鼠心肌梗死模型，模型构建方式为结扎左前降支冠状动脉近端，向其他物种或其他人源样本的外推需谨慎。发布时间标注为 Jun 29 202（原文如此），其完整日期信息源站未提供。
【引用与许可】
数据集作者为 Junwei、Shen，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Multi-omics profiling of mouse myocardial infarction”。引用时应注明该数据集的来源与标题信息。关于许可条款、使用限制或授权方式，源站未提供，使用前应另行核实源站的相关说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE153494
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
心肌梗死（MI）是冠状动脉疾病最严重的表现形式，是一个多因素的病理生理过程。在本研究中，我们通过结扎左前降支冠状动脉近端构建了MI小鼠模型。随后，我们检测并分析了MI后不同时间点（对照、10分钟、1小时、6小时、24小时和72小时）的多组学（转录组和蛋白质组）数据。MI后免疫相关通路、焦亡通路和自噬通路显著增加。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
