血浆外泌体环状RNA hsa_circ_0005540作为冠状动脉疾病新型诊断生物标志物

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE152498

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   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：外泌体几乎存在于所有体液中，含有多种可能反映疾病状态的生物学内容物。环状RNA（CircRNA）结构稳定，在外泌体中半衰期长且不被降解，因而使其成为可靠的生物标志物。然而，外泌体circRNA作为冠状动脉疾病（CAD）生物标志物的潜力仍有待确立。本研究旨在探讨外泌体circRNA的表达水平及其作为CAD诊断生物标志物的潜在应用价值。主要方法：采用RNA测序分析从CAD患者三份血浆样本和三份配对对照样本中获得的外泌体中circRNA的表达水平。在 profiling 阶段获得的外泌体circRNA随后在两个中心验证队列中进行验证。最后，在校正Framingham心脏研究（FHS）危险因素后，确定外泌体circRNA区分CAD患者与非CAD对照者的能力。关键发现：两组之间有355个circRNA存在差异表达：164个上调，191个下调。

我们选取了潜在的circRNAs（倍数变化 > 4，P < 0.05）作为候选生物标志物进行进一步验证。我们的数据显示，只有hsa_circ_0005540与CAD显著相关（P < 0.0001）。在对危险因素进行调整后，hsa_circ_0005540在ROC分析中显示出对CAD的高区分能力（AUC = 0.853；95%置信区间[CI] = 0.799 - 0.906，P < 0.001）。意义：我们的结果表明，血浆外泌体hsa_circ_0005540可作为CAD有前景的诊断生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。