缺血性心脏病血管周围脂肪组织炎症数据集
该数据集来自 NCBI，包含 1 个文件 GSE152326_series_matrix.txt.gz，为缺血性心脏病相关血管周围脂肪组织的基因表达谱芯片数据
基本信息
资源简介
缺血性心脏病血管周围脂肪组织炎症数据集
GSE152326 是一个聚焦缺血性心脏病相关血管周围脂肪组织炎症的基因表达谱数据集，来源于 NCBI，标题为“Perivascular adipose tissue inflammation in ischemic heart disease”。该数据集通过芯片分析比较冠状动脉疾病患者胸主动脉与左乳内动脉周围脂肪组织的基因表达差异，旨在为血管周围脂肪组织在缺血性心脏病中的炎症机制研究提供转录组层面的数据支持。数据集共包含 1 个文件，即 GSE152326_series_matrix.txt.gz，采用 GZIP 压缩格式存储，属于循环系统疾病 / 其他分类，主题涉及表达谱芯片分析，物种为人（9606），平台编号为 GPL26944。整体而言，该数据集规模精简、主题明确，适合作为血管周围脂肪组织基因表达研究的直接数据来源。
【数据集背景】
缺血性心脏病是全球范围内致死和致残的重要原因之一，而血管周围脂肪组织作为紧邻血管壁的活性内分泌组织，其炎症状态被认为与动脉粥样硬化和冠状动脉疾病的发生发展密切相关。该数据集正是围绕这一生物学问题而构建，通过比较冠状动脉疾病患者不同血管床周围脂肪组织的基因表达特征，探索血管周围脂肪组织炎症在缺血性心脏病中的潜在作用。源站描述明确指出，研究者的分析对象为胸主动脉与左乳内动脉周围的血管周围脂肪组织，受试者为人冠状动脉疾病患者。
【数据内容】
该数据集的核心内容为基因表达谱芯片数据，以单个系列矩阵文件 GSE152326_series_matrix.txt.gz 的形式提供。文件采用 GZIP 压缩，解压后为文本格式的系列矩阵，通常包含样本信息、探针或基因标识以及对应的表达值。主题标签显示其属于“Expression profiling by array”，平台为 GPL26944，物种为人（9606）。数据集文件数量为 1，未提供更多分层文件或补充材料。数据所覆盖的样本分组、具体样本数量及表达值分布等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI（ncbi.nlm.nih.gov），作者为 Celestina、Mazzotta，发布时间为 Jun 11 202。数据采集基于人冠状动脉疾病患者的血管周围脂肪组织，比较胸主动脉与左乳内动脉两个部位的组织样本，采用芯片表达谱技术进行检测。平台信息标注为 GPL26944，物种标注为人（9606）。关于样本采集的具体临床信息、伦理审批、纳入排除标准及实验操作流程等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于血管周围脂肪组织炎症与缺血性心脏病关系的探索性研究，可用于比较不同血管床周围脂肪组织的基因表达差异、筛选差异表达基因、开展通路富集分析，也可作为冠状动脉疾病相关转录组研究的验证或整合分析数据来源。此外，该数据可用于方法学层面的芯片数据读取、预处理与质量控制练习，以及作为小规模表达谱数据接入流程的测试样本。
【使用方法】
使用该数据集时，首先下载数据文件 GSE152326_series_matrix.txt.gz，按 GZIP 压缩包格式进行解压和读取。建议先在小样本上核对字段结构、样本标识与编码方式，确认注释信息与表达值对应关系无误后，再进行批量接入与后续分析。分析过程中应结合平台注释信息将探针映射至基因，并根据研究目的进行必要的标准化与质量控制。关于具体的分析流程与参数设置，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个系列矩阵文件，未提供原始芯片图像数据或补充注释文件，数据粒度相对有限。样本量、分组平衡性、临床元数据完整度以及数据质控指标等信息，源站未提供，使用者难以仅凭现有信息全面评估数据质量。此外，该数据基于特定平台 GPL26944 生成，跨平台整合时需注意批次效应与注释差异。数据仅涉及胸主动脉与左乳内动脉周围脂肪组织的比较，结论外推至其他血管床或人群时需谨慎。
【引用与许可】
该数据集的作者为 Celestina、Mazzotta，来源站为 NCBI。使用时应遵循 NCBI 及原始数据提供方的相关使用条款与引用要求。关于具体的许可协议、引用格式及数据使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE152326
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们进行了微阵列分析，比较了冠状动脉疾病患者胸主动脉与左乳内动脉血管周围脂肪组织的基因表达。在主动脉脂肪中，有300个基因显著上调，其中至少63个基因与炎症和动脉粥样硬化相关。qPCR验证显示，WNT-5A相关基因以及CCL-2、CCL-8、JNK和IL-6基因的表达增加。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
